24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2520  |  回复: 11

沫水abc

银虫 (小有名气)

[求助] lammps 模拟粘土的吸附,发现粘土形变的厉害,请问有谁知道是什么原因么? 已有5人参与

问题是这样的:
我在nvt条件下模拟粘土对水溶液中离子的吸附,在用VMD查看结构的时候,发现粘土的结构变形很厉害,不知道是什么原因。图1和2分别是模拟初始和最终的粘土结构。可以看到最终粘土上的各原子分布混乱。
对于粘土,我只计算了键的伸缩势能,角和二面角势能都没有计算
烦请了解的人给一些建议,不胜感激!

lammps 模拟粘土的吸附,发现粘土形变的厉害,请问有谁知道是什么原因么?
1.png


lammps 模拟粘土的吸附,发现粘土形变的厉害,请问有谁知道是什么原因么?-1
2.png
回复此楼
你若盛开清风自来
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木子熙涵

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你用的是什么力场呢?
2楼2016-03-19 13:00:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stormlike

新虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
沫水abc: 金币+3, 有帮助 2016-03-21 13:59:49
粘土只计算了键的伸缩势能,角和二面角势能都没有计算
——那不就是跟LJ势函数差不多?
那就不是黏土,而只是气体分子而已
气体吸附了之后就是这种混乱的样子
3楼2016-03-19 15:12:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 木子熙涵 at 2016-03-19 13:00:30
你用的是什么力场呢?

clayff力场
你若盛开清风自来
4楼2016-03-20 15:38:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stormlike at 2016-03-19 15:12:43
粘土只计算了键的伸缩势能,角和二面角势能都没有计算
——那不就是跟LJ势函数差不多?
那就不是黏土,而只是气体分子而已
气体吸附了之后就是这种混乱的样子

文献中这么说的,只计算原子间的范德华力和库伦作用力,以及粘土上羟基的振动等,其他不算,使粘土保持“rigid”,所以我不太明白这个rigid到底是啥意思?可不可以把势能参数k1、k2这些设置为0呢?
你若盛开清风自来
5楼2016-03-20 15:41:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bluewhale

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
所谓rigid是键、角、二面角的力参数用较大的参数,或者采用约束方法,后者效率高一些。
6楼2016-03-20 22:48:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

花过流年

新虫 (小有名气)

7楼2016-03-20 23:00:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by bluewhale at 2016-03-20 22:48:25
所谓rigid是键、角、二面角的力参数用较大的参数,或者采用约束方法,后者效率高一些。

能说具体一些吗?rigid 采用较大的参数,大到多少丫?您说的约束方法,可以麻烦您细讲讲么
你若盛开清风自来
8楼2016-03-21 13:59:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

digghost

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

边界固定了么,一般模拟表层的时候要固定边界
呵呵了
9楼2016-03-22 08:36:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

闲云野鹤2016

新虫 (小有名气)

in文件可以分享下嘛?我做二氧化钛吸附!想借鉴下!

发自小木虫Android客户端
10楼2017-05-09 18:49:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 沫水abc 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600材料与化工,求调剂 +13 won_qii 2026-04-07 13/650 2026-04-13 14:22 by 张zhihao
[教师之家] 转长聘了 +3 简单化xn 2026-04-13 3/150 2026-04-13 14:18 by wwwkkk83
[考研] 材料工程085601,270求调剂 +38 @ASDF1234 2026-04-08 41/2050 2026-04-13 12:53 by 张zhihao
[考研] 0854调剂 +10 长弓傲 2026-04-11 11/550 2026-04-13 10:38 by wp06
[考研] 一志愿085502,267分求调剂 +17 再忙也要吃饭啊 2026-04-08 18/900 2026-04-13 09:57 by darren_yym
[考研] 0854调剂 +10 长弓傲 2026-04-12 12/600 2026-04-13 08:49 by Sammy2
[考研] 求调剂 +9 吃口冰激凌 2026-04-07 9/450 2026-04-13 08:46 by 紫曦紫棋
[考研] 2本,初试303,0860求调剂 +6 floriea 2026-04-12 8/400 2026-04-12 18:13 by zhouxiaoyu
[考研] 求调剂,262机械专硕 +8 嗯yyl 2026-04-08 8/400 2026-04-12 02:31 by 秋豆菜芽
[考研] 计算机22408 281分,求调剂 +7 17715607211 2026-04-06 7/350 2026-04-12 00:43 by xuxiang
[考研] 280求调剂 +7 兮兮夜夜 2026-04-09 10/500 2026-04-12 00:33 by 蓝云思雨
[考研] 277 数一104,学硕,求调剂 +21 瓶子PZ 2026-04-09 23/1150 2026-04-11 23:12 by labixiaoqiao
[考研] 269电子信息求调剂,可转专业 +11 独酌wl 2026-04-06 11/550 2026-04-11 11:12 by 逆水乘风
[考研] 还有化工二轮调剂的学校吗 5+14 化工人999 2026-04-09 48/2400 2026-04-11 10:27 by 89436494
[考研] 材料与化工调剂 +12 否极泰来2026 2026-04-10 13/650 2026-04-11 00:28 by wangjihu
[考研] 368求调剂 +3 17385968172 2026-04-10 3/150 2026-04-10 20:12 by 电子奥德彪
[考研] 一志愿京区985,085401,与本科专业一致,电子信息工程, +4 阳光开朗的男孩 2026-04-10 4/200 2026-04-10 18:27 by shenrf
[考研] 266求调剂 +29 阳阳哇塞 2026-04-07 29/1450 2026-04-10 16:20 by 高维春
[考研] 一志愿211,化学学硕,310分,本科重点双非,求调剂 +27 努力奋斗112 2026-04-07 30/1500 2026-04-10 15:06 by Kilig0317
[考研] 085601初试330分找调剂 +10 流心奶黄包l 2026-04-09 10/500 2026-04-10 08:14 by Sammy2
信息提示
请填处理意见