24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2518  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

[求助] lammps 模拟粘土的吸附,发现粘土形变的厉害,请问有谁知道是什么原因么? 已有5人参与

问题是这样的:
我在nvt条件下模拟粘土对水溶液中离子的吸附,在用VMD查看结构的时候,发现粘土的结构变形很厉害,不知道是什么原因。图1和2分别是模拟初始和最终的粘土结构。可以看到最终粘土上的各原子分布混乱。
对于粘土,我只计算了键的伸缩势能,角和二面角势能都没有计算
烦请了解的人给一些建议,不胜感激!

lammps 模拟粘土的吸附,发现粘土形变的厉害,请问有谁知道是什么原因么?
1.png


lammps 模拟粘土的吸附,发现粘土形变的厉害,请问有谁知道是什么原因么?-1
2.png
回复此楼
你若盛开清风自来
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stormlike

新虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
沫水abc: 金币+3, 有帮助 2016-03-21 13:59:49
粘土只计算了键的伸缩势能,角和二面角势能都没有计算
——那不就是跟LJ势函数差不多?
那就不是黏土,而只是气体分子而已
气体吸附了之后就是这种混乱的样子
3楼2016-03-19 15:12:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

木子熙涵

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你用的是什么力场呢?
2楼2016-03-19 13:00:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 木子熙涵 at 2016-03-19 13:00:30
你用的是什么力场呢?

clayff力场
你若盛开清风自来
4楼2016-03-20 15:38:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stormlike at 2016-03-19 15:12:43
粘土只计算了键的伸缩势能,角和二面角势能都没有计算
——那不就是跟LJ势函数差不多?
那就不是黏土,而只是气体分子而已
气体吸附了之后就是这种混乱的样子

文献中这么说的,只计算原子间的范德华力和库伦作用力,以及粘土上羟基的振动等,其他不算,使粘土保持“rigid”,所以我不太明白这个rigid到底是啥意思?可不可以把势能参数k1、k2这些设置为0呢?
你若盛开清风自来
5楼2016-03-20 15:41:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 297工科,求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 化工学硕 285求调剂 +29 Wisjxn 2026-04-07 29/1450 2026-04-13 13:47 by floriea
[考研] 求调剂288 +7 ioodiiij 2026-04-10 9/450 2026-04-13 08:33 by Hayaay
[考研] 电气专硕320求调剂 +6 小麻子111 2026-04-10 6/300 2026-04-12 10:54 by lemon6009
[考研] 307求调剂 +10 tzq94092 2026-04-10 10/500 2026-04-12 08:18 by wise999
[考研] 材料与化工300求调剂 +39 肖开文 2026-04-09 43/2150 2026-04-12 01:30 by 秋豆菜芽
[考研] 316求调剂 +5 想读研究生( ?∵ 2026-04-07 5/250 2026-04-12 00:43 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂 +11 翩翩一书生 2026-04-09 11/550 2026-04-11 19:57 by 逆水乘风
[考研] 085506-求调剂-285分 +3 雷欧飞踢 2026-04-08 3/150 2026-04-11 08:37 by zhq0425
[考研] 考研调剂 +26 硕星赴 2026-04-09 27/1350 2026-04-10 22:24 by 猪会飞
[考研] 22408 366分,本科211,一志愿西工大 +4 Rubt 2026-04-09 4/200 2026-04-10 19:51 by chemisry
[考研] 一志愿西交机械专硕求调剂 +8 求上岸的小王 2026-04-10 8/400 2026-04-10 15:09 by hemengdong
[考研] 一志愿中科院105500专业总分315求调剂 +6 lallalh 2026-04-09 7/350 2026-04-09 17:51 by lallalh
[论文投稿] 求助文献原文 10+3 18500821399 2026-04-08 3/150 2026-04-09 16:56 by 北京莱茵润色
[考研] 311求调剂 +6 surte 2026-04-08 13/650 2026-04-09 14:00 by surte
[考研] 086000生物与医药调剂 +7 awwwwwooooo 2026-04-09 7/350 2026-04-09 13:31 by 北极159263
[考研] 308求调剂 +17 墨墨漠 2026-04-06 17/850 2026-04-09 09:25 by 壹往無前
[考研] 求调剂 +13 柒luck 2026-04-07 13/650 2026-04-08 22:46 by 猪会飞
[考研] 313求调剂 +3 十六拾陆 2026-04-07 3/150 2026-04-07 23:20 by lbsjt
[考研] 机械调剂 +3 zzzbcb 2026-04-07 3/150 2026-04-07 22:19 by hemengdong
信息提示
请填处理意见