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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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我是胡子

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助,急,跪谢! 已有3人参与

我准备在大肠杆菌中异源表达并纯化Methanosarcina acetivorans中的acetate kinase (基因locus number为MA3606),请问:
1)该基因稀有密码子含量如何?我该使用什么蛋白表达菌株?
2)选择一种pET载体,使该异源表达的蛋白带上C末端的His tag。
3)设计一个纯化方法,将该蛋白纯化(注明用什么buffer,什么色谱柱,什么流速,柱与柱之间需要进行什么处理,如何检测蛋白等)。
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hc2015

新虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
nono2009: 金币-20, 屏蔽内容, 违规存档, 注册商家也只能在广告区发广告,其它区发广告仍属违规 2016-05-05 21:50:08
本帖内容被屏蔽

4楼2016-05-04 11:43:08
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查看全部 5 个回答

MarchZR

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
简单理解一下问题就是:我该如何表达一个蛋白?楼主你没经验吧,应该是没做过,,,
没做过的知道分析稀有密码子含量很不错,
1.稀有密码子含量,你可以自己分析,你不是在大肠杆菌表达系统嘛,大肠杆菌有自己喜欢和不喜欢的密码子网上一查就知道了(就是密码子优化的步骤)除此之外除了优化密码子还有mRNA结构优化,这就你自己搞了不同的公司有不同的技术(应该属于机密了吧);
2. 你应该用什么表达菌株,一般正常情况下 BL21(DE3)就可以了,当然如有表达的蛋白有毒性或者其他特性就另说了(可以看下这篇文章,http://www.detaibio.com/topics/yuan-he-biao-da-faq.html,看原核表达FAQ那个,7 8M的打开会有点慢,里面说的挺好);
3. 你是原核表达 pet系列你都可以选择,带上his也很正常有利于纯化吗,亲和纯化哈
4. 纯化方法?你都his了,当然亲和纯化,至于你说的什么流速什么buffer什么色谱柱,这个。。。。这都需要有蛋白纯化工作经验至少一两年以上的才能准确回答你,这些因素就是实验摸索的一个过程,恰恰是最重要的,针对不同的蛋白性质也不一样,所以没有固定答案,你还是好好学习亲和纯化原理,如何大概操作步骤,中间的试剂等等自己摸索,纯化有时候buffer不对,结果都会千差万别的,有时候还包涵体更麻烦,上清就好些了
5.检测蛋白,检测蛋白比较简单,跑SDS-PAGE就可以,你的蛋白大小多大你是知道的,只需要在胶上面看看有没有表达就行,没有表达那就不好办了,原因多种更要摸索,如果表达量低,可以在做Western blot定性一下,看看到底有没有,实在不放心也可以切胶测序吗,,,提供一些资料:祝好运,资料如下:
蛋白表达系统介绍:原核酵母哺乳动物系统/原理/操作步骤/FAQ
SDS=PAGR实验原理/操作步骤/相关FAQ
Western blot实验原理/操作步骤/相关FAQ
原核表达FAQ包括蛋白不表达,蛋白表达不在上清
蛋白纯化:http://wenku.baidu.com/view/521ff9cec281e53a5902ff27
2楼2016-03-18 16:06:49
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MarchZR

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

蛋白表达系统原核/真核/酵母/哺乳动物系统/原理/操作步骤/FAQ:http://www.detaibio.com/topics/dan-bai-biao-da.html
蛋白不表达,蛋白表达不在上清:http://www.detaibio.com/topics/yuan-he-biao-da-faq.html
SDS-PAGE实验原理/步骤/FAQ:http://www.detaibio.com/topics/sds-page-technology.html
Western blot原理实验操作FAQ:http://www.detaibio.com/material-western-blot.html
3楼2016-03-18 16:10:40
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hc-material

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

问题太多了,太宽泛。his  taq融合蛋白都用镍螯合高流速琼脂糖凝胶纯化。具体买填料会有说明书。祝顺利。
5楼2016-05-13 15:57:17
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