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喵喵小猫鱼

新虫 (初入文坛)

[求助] PCR产物测序后发现有片段丢失 已有5人参与

我做PCR,将回收的产物连接载体测序后发现:我的目的片段(~150bp)两端引物部分的序列都是对的,但是引物之间的部分基本都丢失了,只剩下十几个bp,想知道是什么原因,请大家指教。
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喵喵小猫鱼

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 卡维斯 at 2016-03-15 21:11:32
连接载体后需要做菌落PCR初步验证目的条带大小,然后选择正确大小条带的送样测序。
测序公司测序过程中会出现这样的问题,可要求免费重测。

应该不是公司测序的问题,因为第二次重新连接载体转化后再次提质粒测序,结果还是有问题,引物之间的片段还是不对

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
9楼2016-03-15 21:54:23
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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引物之间只剩几十bp?你确定是你的目的片段丢失,而不是根本就没有连上目的片段么?建议你分析一下引物之间那几十bp,看看是不是多克隆位点。

发自小木虫Android客户端
天空才是极限,我有信心飞的更高!
2楼2016-03-15 20:07:50
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喵喵小猫鱼

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-03-15 20:07:50
引物之间只剩几十bp?你确定是你的目的片段丢失,而不是根本就没有连上目的片段么?建议你分析一下引物之间那几十bp,看看是不是多克隆位点。

并没有多克隆位点,而且我从模板上克隆目的片段后的电泳结果条带挺好的,不知道为什么,测序出来就没有了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2016-03-15 20:29:08
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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-03-15 20:07:50
引物之间只剩几十bp?你确定是你的目的片段丢失,而不是根本就没有连上目的片段么?建议你分析一下引物之间那几十bp,看看是不是多克隆位点。

从模板上克隆挺好的,是什么意思?指你的PCR获得的目的产物么?

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天空才是极限,我有信心飞的更高!
4楼2016-03-15 20:35:40
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