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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » NCBI中对比结果，我应该选择哪个比较靠谱
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11石宝

新虫 (小有名气)

[求助] NCBI中对比结果，我应该选择哪个比较靠谱已有2人参与

倒数一和二这俩结果，我应该选择哪个？前者的query cover为99%，identity为98%，后者为96%和99%。急等结果，请解释下原因，谢谢

NCBI中对比结果，我应该选择哪个比较靠谱
主要看倒数的一、二两个结果
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1楼2016-03-13 20:32:16
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11石宝

新虫 (小有名气)
在韩国人那个网站查得结果是后者的属相似度高于前者，但是都没有提到图中两个序列的菌

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2楼2016-03-13 21:08:44
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Nabarro

新虫 (小有名气)
坐等
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3楼2016-03-14 09:12:20
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haorui123456

新虫 (小有名气)
对菌株进行鉴定不能只参考序列比对结果，还需要结合生理生化反应，得到的结果才可靠。

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4楼2016-03-14 09:22:19
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lvshilu

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
查一下文献，看看这两种是不是非常近缘的菌种，如果是，查文献找区分二者的标记：生化标记、遗传标记都行
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5楼2016-03-15 11:23:47
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wubingqi

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
11石宝: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-04-08 19:37:05
11石宝: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-04-10 14:53:23
光比较16s，鉴定不到种的，你还是得做生理生化试验，甚至是杂交。
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6楼2016-03-16 12:37:50
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luckyever99

新虫 (初入文坛)
想要确定你的菌株离哪个种比较近直接以16s序列画一个进化树就可以知道了

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7楼2016-03-17 00:05:47
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二十一业

铜虫 (小有名气)
16S就只能大概看一下，没法确证的，最具操作性的菌种鉴定策略，现在首选基因组测序比ANI，具体咨询ACCC
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8楼2016-06-14 15:10:30
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