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11石宝

新虫 (小有名气)

[求助] NCBI中对比结果,我应该选择哪个比较靠谱 已有2人参与

倒数一和二这俩结果,我应该选择哪个?前者的query cover为99%,identity为98%,后者为96%和99%。急等结果,请解释下原因,谢谢

NCBI中对比结果,我应该选择哪个比较靠谱
主要看倒数的一、二两个结果
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11石宝

新虫 (小有名气)

在韩国人那个网站查得结果是后者的属相似度高于前者,但是都没有提到图中两个序列的菌

发自小木虫IOS客户端
2楼2016-03-13 21:08:44
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Nabarro

新虫 (小有名气)

3楼2016-03-14 09:12:20
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haorui123456

新虫 (小有名气)

对菌株进行鉴定不能只参考序列比对结果,还需要结合生理生化反应,得到的结果才可靠。

发自小木虫Android客户端
4楼2016-03-14 09:22:19
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lvshilu

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
查一下文献,看看这两种是不是非常近缘的菌种,如果是,查文献找区分二者的标记:生化标记、遗传标记都行
需要金币
5楼2016-03-15 11:23:47
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wubingqi

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
11石宝: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-04-08 19:37:05
11石宝: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-04-10 14:53:23
光比较16s,鉴定不到种的,你还是得做生理生化试验,甚至是杂交。
6楼2016-03-16 12:37:50
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luckyever99

新虫 (初入文坛)

想要确定你的菌株离哪个种比较近直接以16s序列画一个进化树就可以知道了

发自小木虫Android客户端
7楼2016-03-17 00:05:47
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二十一业

铜虫 (小有名气)

16S就只能大概看一下,没法确证的,最具操作性的菌种鉴定策略,现在首选基因组测序比ANI,具体咨询ACCC
8楼2016-06-14 15:10:30
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