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吕木木

新虫 (小有名气)

[求助] PCR程序 已有2人参与

我要克隆1900bp的片段,用的GXL酶,反应体系是:模板1微升,5×GXL Buffer5微升,MIXdNTP 2微升,引物1微升,酶0.5微升,ddH2O至25微升。
对应程序:94℃30 s,72℃ 2 min,5 个循环;94℃ 30 s,(温度梯度)70℃ 40 s,
72℃ 2 min,5 个循环;94℃ 30 s,(温度梯度)68℃ 40 s,72℃ 2
min,30 个循环;72℃ 10 min,4℃保存,但是一直跑不出来,什么条带都没有,跑了一个学期了,请问怎么修改程序或体系,温度梯度怎么设置?
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gnot_nail

金虫 (正式写手)

这条件是按说明书来的吗?为啥会有5个循环……

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2楼2016-03-05 21:22:16
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sandycool

铁虫 (正式写手)

你好,请问一下,你的反转录用的哪个试剂盒?

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3楼2016-03-05 21:58:48
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sandycool

铁虫 (正式写手)

现在有takara的两个反转录试剂盒,一个是primescript 1st cDNA 试剂盒,另外一个是去除gDNA的试剂盒,不知道用哪个更好

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4楼2016-03-05 22:01:27
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吕木木

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sandycool at 2016-03-05 21:58:48
你好,请问一下,你的反转录用的哪个试剂盒?

塔克拉的

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5楼2016-03-05 22:10:19
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吕木木

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gnot_nail at 2016-03-05 21:22:16
这条件是按说明书来的吗?为啥会有5个循环……

这个程序是以前师兄师姐用过的,一样的品种,一样的酶,只是基因不一样

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6楼2016-03-05 22:11:05
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吕木木

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gnot_nail at 2016-03-05 21:22:16
这条件是按说明书来的吗?为啥会有5个循环……

我很着急,从上个学期开始跑了,一直没什么进展,每天都在跑程序,换引物

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7楼2016-03-05 22:12:00
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sandycool

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 吕木木 at 2016-03-05 22:10:19
塔克拉的
...

请问是takara的哪一款?有一个除基因组DNA的,有一个是1st strand synthesis,具体是哪一款?谢谢

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8楼2016-03-05 22:17:16
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gnot_nail

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
6楼: Originally posted by 吕木木 at 2016-03-05 22:11:05
这个程序是以前师兄师姐用过的,一样的品种,一样的酶,只是基因不一样
...

不要盲目相信前辈啦,基因不一样的话,如果长度不一样,延伸时间就不一样,退火温度也不同,问题还可能出现在引物上,我觉得你可以看看酶的说明书,按上面的来。

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9楼2016-03-05 22:29:59
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吕木木

新虫 (小有名气)

我知道,延伸时间我自己改了的,退火温度做了温度梯度

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10楼2016-03-05 22:42:59
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