24小时热门版块排行榜    

查看: 1813  |  回复: 13

取个什么名啊

木虫 (正式写手)

[求助] 引物设计 已有4人参与

从NCBI上下了一个基因的序列,要从细菌中扩增整个序列,使用primer primer设计一对引物,请问一下在选择引物上下游位置的时候怎么填写?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

oceansr

新虫 (初入文坛)

2楼2016-03-01 15:40:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我用的primer5,手动的拖着看就好,调整一下长短,不废劲的。
3楼2016-03-01 16:15:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jackyoung

新虫 (正式写手)

你括增整个序列是什么意思?编码区还是全长cDNA序列?你查到的序列是个啥?先说清楚

发自小木虫Android客户端
CestLaVie
4楼2016-03-02 08:34:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

取个什么名啊

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hanxiaominhu at 2016-03-01 16:15:17
我用的primer5,手动的拖着看就好,调整一下长短,不废劲的。

这张图片中这个引物的上下游位置怎么确定?
引物设计
图片1.png

5楼2016-03-02 08:39:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

取个什么名啊

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jackyoung at 2016-03-02 08:34:26
你括增整个序列是什么意思?编码区还是全长cDNA序列?你查到的序列是个啥?先说清楚

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... amp;amp;strand=true,这个是我找的基因,从细菌中扩增这段序列,用primer怎么设计引物?
6楼2016-03-02 08:44:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jackyoung

新虫 (正式写手)

CestLaVie
7楼2016-03-02 08:51:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 取个什么名啊 at 2016-03-02 08:39:42
这张图片中这个引物的上下游位置怎么确定?

图片1.png
...

你要是search的话主要是把扩增产物长度(PCR product size)改一下,你要是彻底扩增整个序列的话,就把产物大小放到最大,两个引物的位置可以不用管。我说的手动拖是在上一个界面上拖动引物位置就可以了。
8楼2016-03-02 09:03:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

开心的加菲猫

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
CDS区本身就771个碱基,可以不选择,设计产物大小,引物大小就可以了
9楼2016-03-02 10:25:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

取个什么名啊

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by hanxiaominhu at 2016-03-02 09:03:03
你要是search的话主要是把扩增产物长度(PCR product size)改一下,你要是彻底扩增整个序列的话,就把产物大小放到最大,两个引物的位置可以不用管。我说的手动拖是在上一个界面上拖动引物位置就可以了。...

好的我回去试一下,谢谢!

发自小木虫Android客户端
10楼2016-03-02 12:32:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 取个什么名啊 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:22 by oEVWOejN9taj
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:19 by oEVWOejN9taj
[找工作] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:07 by oEVWOejN9taj
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 16:47 by oEVWOejN9taj
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:02 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 5/250 2026-08-08 15:59 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 十年后又回来了,论文投稿求助 +5 哈哈114477 2026-08-01 5/250 2026-08-08 15:14 by 仁砚薪传
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:42 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:39 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +5 a089 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:04 by alian_214
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:01 by oEVWOejN9taj
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 3/150 2026-08-08 03:47 by 6vVgjDL4CnGu
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
信息提示
请填处理意见