24小时热门版块排行榜    

查看: 1885  |  回复: 13

取个什么名啊

木虫 (正式写手)

[求助] 引物设计 已有4人参与

从NCBI上下了一个基因的序列,要从细菌中扩增整个序列,使用primer primer设计一对引物,请问一下在选择引物上下游位置的时候怎么填写?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

oceansr

新虫 (初入文坛)

2楼2016-03-01 15:40:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我用的primer5,手动的拖着看就好,调整一下长短,不废劲的。
3楼2016-03-01 16:15:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jackyoung

新虫 (正式写手)

你括增整个序列是什么意思?编码区还是全长cDNA序列?你查到的序列是个啥?先说清楚

发自小木虫Android客户端
CestLaVie
4楼2016-03-02 08:34:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

取个什么名啊

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hanxiaominhu at 2016-03-01 16:15:17
我用的primer5,手动的拖着看就好,调整一下长短,不废劲的。

这张图片中这个引物的上下游位置怎么确定?
引物设计
图片1.png

5楼2016-03-02 08:39:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

取个什么名啊

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jackyoung at 2016-03-02 08:34:26
你括增整个序列是什么意思?编码区还是全长cDNA序列?你查到的序列是个啥?先说清楚

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... amp;amp;strand=true,这个是我找的基因,从细菌中扩增这段序列,用primer怎么设计引物?
6楼2016-03-02 08:44:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jackyoung

新虫 (正式写手)

CestLaVie
7楼2016-03-02 08:51:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 取个什么名啊 at 2016-03-02 08:39:42
这张图片中这个引物的上下游位置怎么确定?

图片1.png
...

你要是search的话主要是把扩增产物长度(PCR product size)改一下,你要是彻底扩增整个序列的话,就把产物大小放到最大,两个引物的位置可以不用管。我说的手动拖是在上一个界面上拖动引物位置就可以了。
8楼2016-03-02 09:03:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

开心的加菲猫

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
CDS区本身就771个碱基,可以不选择,设计产物大小,引物大小就可以了
9楼2016-03-02 10:25:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

取个什么名啊

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by hanxiaominhu at 2016-03-02 09:03:03
你要是search的话主要是把扩增产物长度(PCR product size)改一下,你要是彻底扩增整个序列的话,就把产物大小放到最大,两个引物的位置可以不用管。我说的手动拖是在上一个界面上拖动引物位置就可以了。...

好的我回去试一下,谢谢!

发自小木虫Android客户端
10楼2016-03-02 12:32:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 取个什么名啊 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-16 02:14 by DgNGHc3h5tPl
[考博] 申博发邮件 +4 Lmengk 2026-09-15 4/200 2026-09-16 00:05 by 木心想继续深造
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 3/150 2026-09-15 19:50 by CgyNCDVNhGVg
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 0pYnUiPDfdnk 2026-09-14 3/150 2026-09-15 19:35 by CgyNCDVNhGVg
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 23jxep3nCNZb 2026-09-14 3/150 2026-09-15 18:47 by CgyNCDVNhGVg
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 17:39 by CgyNCDVNhGVg
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-15 16:15 by CgyNCDVNhGVg
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-15 15:35 by CgyNCDVNhGVg
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 3/150 2026-09-15 15:27 by CgyNCDVNhGVg
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-15 15:14 by CgyNCDVNhGVg
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 14:38 by VMDqgnlKimtZ
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-15 14:22 by VMDqgnlKimtZ
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:26 by C79jjtjAKjEn
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 08:02 by C79jjtjAKjEn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 08:02 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:38 by 5BDX0d0WFp7t
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:25 by vZfe6xYu34yj
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 21:37 by vZfe6xYu34yj
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 浙江师范大学是怎么坑我的 +6 recruit123 2026-09-09 6/300 2026-09-14 12:00 by 萨仁其其格
信息提示
请填处理意见