24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1670  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

qiulinqiong

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

po390

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也是分子模拟小白,题主给的信息我分析不出太多。题主是用ambertools生成的crd和top文件在namd下模拟,还是只用在charmm力场文件格式下的amber力场参数文件?

对配体进行怎样的限制?是固定位置,在模拟过程中不动的话,参考楼上的建议就可以了。但如果是把配体限制在一定范围内,需要看下Harmonic restraint parameters的设置,或者用tclforce也可以,但个人感觉都不是很方便,在这方面,Gromacs的操作要比NAMD方便很多。
9楼2016-03-02 16:06:39
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

声梦奇缘001

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
看看 NAMD 官网上的 碳管中的水分子的教程,着重看一下对碳管的处理,你就懂了!
只做不说,明知没地位,坚信有机会
7楼2016-03-02 08:11:58
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiulinqiong

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

8楼2016-03-02 09:10:13
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiulinqiong

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

10楼2016-03-02 18:17:02
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 生物考研337分求调剂 +3 cgxin 2026-03-30 4/200 2026-03-30 23:00 by Evan_Liu
[考研] 285求调剂 +6 AZMK 2026-03-29 9/450 2026-03-30 21:02 by dophin1985
[考研] 一志愿郑大材料工程290求调剂 +11 Youth_ 2026-03-30 11/550 2026-03-30 21:01 by peike
[考研] 08工科,295,接受跨专业调剂 +3 lmnlzy 2026-03-30 3/150 2026-03-30 17:49 by wangjy2002
[考研] 324求调剂 +9 hanamiko 2026-03-26 11/550 2026-03-30 14:27 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +7 青春裁为三截 2026-03-29 7/350 2026-03-30 13:14 by laoshidan
[硕博家园] 求调剂 有机化学考研356分 +10 Nadiums 2026-03-25 11/550 2026-03-30 11:56 by yjolah
[考研] 318一志愿吉林大学生物与医药 求调剂 +5 笃行致远. 2026-03-28 5/250 2026-03-30 06:56 by ilovexiaobin
[考研] 调剂310 +12 温柔的晚安 2026-03-25 13/650 2026-03-29 20:01 by 无际的草原
[考研] 340求调剂 +6 Amber00 2026-03-26 6/300 2026-03-29 12:06 by 无际的草原
[考研] 求调剂 +7 争取九点睡 2026-03-28 8/400 2026-03-28 21:07 by 争取九点睡
[考研] 一志愿华理,数一英一285求A区调剂 +8 AZMK 2026-03-25 12/600 2026-03-28 18:15 by AZMK
[考研] 275求调剂 +10 jjjjjjjjjjl 2026-03-27 10/500 2026-03-27 23:47 by barnett0632
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +7 18419759900 2026-03-25 8/400 2026-03-27 16:38 by 18419759900
[考研] 085601 材料工程 313分 求调剂 +5 Ong3 2026-03-27 5/250 2026-03-27 12:24 by goldfish51
[考研] 314求调剂 +3 溪云珂 2026-03-26 3/150 2026-03-27 11:20 by sanrepian
[考研] 341求调剂 +7 青柠檬1 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:19 by wxiongid
[考研] 求调剂 一志愿 本科 北科大 化学 343 +6 13831862839 2026-03-24 7/350 2026-03-26 22:57 by 不吃魚的貓
[考研] 347求调剂 +4 L when 2026-03-25 4/200 2026-03-25 13:37 by cocolv
[考研] 一志愿吉林大学材料与化工303分求调剂 +4 为学666 2026-03-24 4/200 2026-03-25 11:27 by BruceLiu320
信息提示
请填处理意见