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骑乌龟搞学术

金虫 (小有名气)

[求助] Blast使用

怎样用Blast找到已知的引物所扩增目的片段大小，具体步骤是什么
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1楼 2016-02-29 18:40:53
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wx3280065

银虫 (小有名气)
看你模板是什么，如果是cDNA，前后引物blast结果如果在同一个mRNA序列上，那么做差就行，如果是gDNA那么推荐去ensembl （植物的话去ensembl plant）做blast直接用供试材料的基因组为模板，这样不仅能看产物长度，还可以看特异性。如果是测序产物的话推荐用bioedit建立一个本地数据库，然后做blast

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2楼2016-02-29 18:48:24
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