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G号糖

木虫 (正式写手)

[求助] 请教pcr电泳方面问题 已有1人参与

最近做了一般pcr,结果电泳图感觉不行,想请教分析哈原因。如图,基因扩增片段大概1000bp,所以最下方是什么条带?怎么避免呢

请教pcr电泳方面问题


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G号糖

木虫 (正式写手)

还有提出来的DNA电泳检验也是这样,这又什么原因呢?

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2楼2016-02-27 16:55:18
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反应链

新虫 (正式写手)

The bands less than 100bp in size were primer dimers or RNA contaminations. When you extract DNA, treat the pellets with TE containing RNaseA at 37 degrees Celsius for 1 hour. When you amplify the target genes, use less primers and higher annealing temperature. By the way, set the positive and negetive controls on every experiment, which is  really helpful to find out the carrier.

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3楼2016-02-27 19:08:46
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G号糖

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 反应链 at 2016-02-27 19:08:46
The bands less than 100bp in size were primer dimers or RNA contaminations. When you extract DNA, treat the pellets with TE containing RNaseA at 37 degrees Celsius for 1 hour. When you amplify the ta ...

谢谢!还是英文版的

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4楼2016-02-27 22:24:49
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fudan671

木虫 (著名写手)

提高温度,其他dna记得加入rna酶

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5楼2016-02-28 13:21:16
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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲,勿施于人

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
最下方条带引物二聚体,不用在意
适当降低引物浓度,提高模板浓度,减少循环数可以减少引物二聚体,不过对大部分实验没有影响,也可以切胶纯化
The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
6楼2016-03-01 03:52:23
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MarchZR

银虫 (小有名气)

首先,最下方的是二聚体,PCR常见的问题,因为用酶不当,酶的特异性灵敏度不高,配置体系虽然在冰上也难以避免产生二聚体(可以用热启动Taq酶,可以先了解一下原理)
其次,胶浓度是多少,marker好像没有分离开,,
最后,你的目的片段出来了吗。。。应该没有出来吧,上方最亮的那条带应该不是目的条带
吧,,,,
PCR标准操作流程:
http://www.detaibio.com/topics/pcr-sop.html
热启动Taq酶的原理:
http://wenku.baidu.com/link?url=MdqQTlGAtQFbBE3HCutlKDyS_iNwkJkMLeiIheIMFjVGuMGxE_sykvWv9zNYSAHtZmOt_kWuxFIMe6hjfoEt6D60-TBn_KAEF2NJnh03ORK
7楼2016-03-09 09:09:14
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