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四叶草_lin

金虫 (初入文坛)

[求助] 请问，用基因组DNA和cDNA做模板进行PCR有什么区别呀？

请问，用基因组DNA和cDNA做模板进行PCR有什么区别呀？我看到一篇文献，作者用cDNA做得不到扩增，就用基因组DNA做，又出现扩增的，引物也算能用的，这是为什么呢？
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1楼 2012-10-04 11:58:56
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策马入林

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 金币+3, 鼓励发帖交流问题。 2012-10-04 18:31:42
amisking: 回帖置顶 2012-10-04 18:31:43
四叶草_lin: 金币+1, ★有帮助 2012-10-04 21:36:53
情况可能是这样的：1，如楼上所说他设计引物时候使用的模板可能是含有内含子的，而且引物位置正好在内含子区域。
2.我猜测还有可能是条件不同，那个人的文献中又说他做过多少的尝试吗，我刚做pcr那会一直没扩增出来（cdna），后来重新做了一批并且过了一段时间后再p，都出来了，很奇异的，呵呵
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3楼2012-10-04 15:12:36
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普通回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。 2012-10-04 18:31:33
那就只能说明他的引物是根据内含子设计的嘛。
如果是在外显子区设计的引物那就不可思议了。
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2楼2012-10-04 14:59:04
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once1015

木虫 (正式写手)
针对真核生物，基因组有内含子
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4楼2012-10-06 12:50:35
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兵缘

新虫 (初入文坛)
那个也有可能是退火温度不对 建议做个梯度退火温度实验
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5楼2012-10-08 21:31:21
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丹丹317

金虫 (初入文坛)
在引物设计方面可能有些问题吧，可以重新设计下引物看看
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fighting
6楼2013-07-22 18:48:44
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ganlanzhih
谢谢分享！
7楼2014-09-14 08:53:13
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