24小时热门版块排行榜    

查看: 5140  |  回复: 8

emilyoyang

木虫 (正式写手)

[求助] 如何用xcrysden画电荷密度图

相关电荷密度文件都已经做好了,用xcrysden读入电荷密度后,Tools->Data Grid,然后出来Isosurface/Property-plane Controls,看manual没看太明白,想请教一下,如何调节相关的参数,来显示比较美观的电荷密度图?
已知道有很多选项可调,所以想请教 最基本的一些参数如何调节?该设置多少?有什么原则没有?谢谢~~~
另外,请教坛子里的大侠们 什么软件能够做出来漂亮的电荷密度图? VESTA,vaspview 已尝试过,想问有没有其它的软件? 再次感谢~
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VASP

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lisicheng

木虫 (著名写手)

我在漂泊中

修改文章,发现也需要做contour map,一头雾水。关注此贴,懂的人们,赶紧帮帮忙吧。。。。。。。
我来是因为我寂寞。
2楼2013-01-21 14:40:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zphu_nku

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
sunyang1988: 金币+2, 谢谢帮助 2013-07-26 19:48:46
首先要知道文件里面数值的含义,简单说就是你xsf文件的grid里面包含几个电子,把各点数值积分起来应该等于这个电子数,实际上就是你要得到一个换算的系数,然后才能正确知晓给出的isosurface的具体值是多少
至于颜色按自己的喜好和易于让人看懂为原则,因为大部分人要么在电脑上看要么在纸上看,所以配色在灰度情况下仍能反应问题很重要,要考虑到色盲人群。
3楼2013-07-23 10:36:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡崔娜

新虫 (小有名气)

楼主已经学会怎么画这个图了么? 我刚学到这里,也是计算出了电荷图的文件,但是不知道怎么画图~~求指教
曲终人散,谁无过错
4楼2013-09-14 09:33:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

redskywei

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
liliangfang: 金币+2, 谢谢交流 2013-09-15 09:06:18
首先,你要确定你的xsf文件里只有电荷密度一种数据,而且是没考虑自旋的,画出来的就是总电荷密度。如果有自旋,选择tool/data后要对你的自旋选项进行设置:是要两个相加、相减、或者只要其中一个。然后确定就出现了Isosurface/Property-plane Controls,这里第一个要设置的就是isovalue,如果是自旋差值的话多半还要勾选羡慕的render,正负iso面就是不同颜色了。右边的四个选项你选了马上就明白啥意思,我不一一说明了。最右下角有个关于透明色彩的设置,里面有很多选择方案,看你喜欢那种了。进去试试就知道了。多数默认就很漂亮了。

二,如果你不想要这种等值面的形式,想要面,就要把最上面的display isosurface勾掉,但是下面的值不要空着。 然后选择你要的平面,他只有三个xyz面,你任选其一,点开后有关于标尺色系、标尺刻度等设置,羡慕的display中最后一个therometer in toplevel不要勾选,那样打印不出。然后点击下面的箭头移动平面。到你想要的位置。特别注意那个format string,里面那个8.4f里的4,就是设置你的颜色标尺的小数点的,根据需要调整,这个是否还有其他的东西需要高手补充0。No of Tics是设置颜色标尺的颜色种类个数的。
       这些都是实时显示的,做两遍就都清楚了。其他的range、isoline都看英文就明白了。写了这么多,好累,希望你看明白了。
坠入无边的网~~
5楼2013-09-14 22:40:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fansw1129

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by redskywei at 2013-09-14 22:40:20
首先,你要确定你的xsf文件里只有电荷密度一种数据,而且是没考虑自旋的,画出来的就是总电荷密度。如果有自旋,选择tool/data后要对你的自旋选项进行设置:是要两个相加、相减、或者只要其中一个。然后确定就出现了 ...

楼上用的是那款程序?
6楼2016-09-06 15:10:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meizhixin

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by redskywei at 2013-09-14 22:40:20
首先,你要确定你的xsf文件里只有电荷密度一种数据,而且是没考虑自旋的,画出来的就是总电荷密度。如果有自旋,选择tool/data后要对你的自旋选项进行设置:是要两个相加、相减、或者只要其中一个。然后确定就出现了 ...

你好,我用xcrysden分析电荷密度,想画出图1那种效果,怎么调节颜色,我的只显示一片蓝色
如何用xcrysden画电荷密度图



发自小木虫Android客户端
7楼2017-03-17 15:30:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meizhixin

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by redskywei at 2013-09-14 22:40:20
首先,你要确定你的xsf文件里只有电荷密度一种数据,而且是没考虑自旋的,画出来的就是总电荷密度。如果有自旋,选择tool/data后要对你的自旋选项进行设置:是要两个相加、相减、或者只要其中一个。然后确定就出现了 ...

图没发成功,重发下
如何用xcrysden画电荷密度图-1



发自小木虫Android客户端
8楼2017-03-17 15:33:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小幸运啊啊

禁虫 (初入文坛)

本帖内容被屏蔽

9楼2018-09-06 10:38:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 emilyoyang 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 303求调剂 +4 今夏不夏 2026-03-01 4/200 2026-03-01 14:46 by 嘟嘟小浣熊
[考研] 307求调剂 +3 wyyyqx 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:42 by ms629
[考研] 课题组接收材料类调剂研究生 +3 gaoxiaoniuma 2026-02-28 4/200 2026-03-01 14:30 by jjj三跨
[考研] 一志愿中南大学理学化学 +3 15779376950 2026-03-01 4/200 2026-03-01 14:27 by 15779376950
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[考研] 材料学调剂 +8 提神豆沙包 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:14 by peike
[考研] 0805总分292,求调剂 +3 幻想之殇 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:11 by yc258
[考研] 化工299分求调剂 一志愿985落榜 +4 嘻嘻(*^ω^*) 2026-03-01 4/200 2026-03-01 13:15 by wang_dand
[考研] 0856材料专业298分有科研经历 硕士研究生调剂自荐信 +6 zyf上岸 2026-03-01 6/300 2026-03-01 12:43 by liqiongjy
[考研] 寻找调剂 +4 LYidhsjabdj 2026-02-28 4/200 2026-03-01 10:56 by sunny81
[考博] 博士自荐 +4 kkluvs 2026-02-28 4/200 2026-03-01 10:19 by 馥安馥安
[硕博家园] 2025届双非化工硕士毕业,申博 +3 更多的是 2026-02-27 4/200 2026-03-01 10:04 by ztg729
[考研] 0856求调剂285 +6 吕仔龙 2026-02-28 6/300 2026-03-01 10:03 by wang_dand
[硕博家园] 博士自荐 +6 科研狗111 2026-02-26 10/500 2026-03-01 10:02 by 科研狗111
[考研] 化工专硕348,一志愿985求调剂 +4 弗格个 2026-02-28 6/300 2026-02-28 22:00 by wang_dand
[考研] 295求调剂 +5 19171856320 2026-02-28 5/250 2026-02-28 21:39 by gaoxiaoniuma
[考博] 26申博 +4 想申博! 2026-02-26 4/200 2026-02-28 21:37 by limorning
[考研] 264求调剂 +3 巴拉巴拉根556 2026-02-28 3/150 2026-02-28 21:31 by gaoxiaoniuma
[考研] 276求调剂 +3 路lyh123 2026-02-28 4/200 2026-02-28 19:45 by 路lyh123
[考研] 304求调剂 +5 曼殊2266 2026-02-28 6/300 2026-02-28 12:44 by 迷糊CCPs
信息提示
请填处理意见