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分类	共搜索到 64 个相关话题(最多显示前5000个)	作者	最后发表

导师招生	澳大利亚新南威尔士大学招收生物信息博士 UniversityofNewSouthWales(UNSWSydney)....Familiaritywithmicrobiomeanalysistools(e.g.,QIIME2,HUMAnN3,MetaPhlAn,DESeq2)isdesirable.ScholarshipandSupport....	gon123	2025-06-19 12:30
硕博家园	澳大利亚新南威尔士大学招收生物信息博士 UniversityofNewSouthWales(UNSWSydney)....Familiaritywithmicrobiomeanalysistools(e.g.,QIIME2,HUMAnN3,MetaPhlAn,DESeq2)isdesirable.ScholarshipandSupport....	gon123	2025-06-18 11:28
电脑使用	qiime2 安装求助我的qiime2已经安装激活成功了，但是输入qiime-help指令的时候又显示commandnotfound，请问这是什么原因呢？又应该如何解决呢？xiaoming93lvcong358	香蕉vs菠萝	2023-10-12 10:28
硕博家园	申请农学大类博士本人本科西部211农学类专业，硕士毕业于南方双非院校，硕士主要研究施肥措施下土壤及根际微生物菌群的变化，熟练掌握分子实验如DNA提取.PCR扩增等，熟练使用QIIME2.R语言等进行数据分析，...	我想要什么	2022-09-19 02:31
微生物	有没有生信微生物测序方面的大佬分享一下资料，或者详细流程什么的呢。比如qiime，usearch等等啦越详细的越好～	tanglianfa	2022-01-10 02:34
生物科学	外泌体相关研究文献分享,轻松读完一篇文献（十）对于每一个代表性序列，QIIME2中的特征分类器和classifyconsensus-blast算法被用来基于从NCBI数据库中检索到的信息来注释分类。为了分析不同ASVs之间的序列相似性，使用QIIME2比对MAFFT对照...	NanoFCMlxq	2021-10-23 08:26
微生物	求样本两两之间共有物种数。现有一个类似于OTU表的文件，不是biom格式的OTU表。目标：求各样本两两之间的共有的OTU数，应该是一个对称矩阵，怎么实现谢谢！PS：手头上没有QIIME,且就是一个excel文件	hustxiong	2021-03-02 11:55
生物科学	要学习应用QIIME 2 软件，Windows是装双系统还是直接装虚拟机啊不懂就问，谢谢解答	很多问号	2020-05-17 03:07
微生物	求分享QIIME的虚拟机安装文件，谢谢呀我在官网上下载了一天都都没下载下来，求助大家分享呀，谢谢呀	ZOE.LAi	2020-03-09 02:51
资源求助	求助QIIME 1.9.1 64-bit的虚拟机安装文件，谢谢呀求助QIIME1.9.164-bit的虚拟机安装文件，谢谢呀。我下载了一天多还是没下载下来。	ZOE.LAi	2020-03-09 02:17
论文投稿	对于审稿人的提问不甚理解，求大佬解答在方法部分引用了一些测序平台以及处理软件的网址，如下面这样：Alltheraw16srDNAgenesequencedatawereprocessedintheQIIMEpipeline(V1.9.1,'http://qiime.org/tutorials/tutorial.html).'...	小猪猪爱吃肉	2020-02-23 03:45
微生物	初学者入门16s扩增子高通量测序分析之固态硬盘自己搭建，自己安装linux系列的操作系统，安装qiime软件等其它需要的诸多分析软件，对一个初学者而言往往要消耗大量的时间在这个准备阶段。而且还需要配置一个额外的电脑或者安装双系统，...	道阻且长94	2019-11-18 05:13
程序语言	windows的IDM下载东西使用IDM插件下载qiime官网上的镜像的时候，报错，421Therearetoomanyconnectionsfromyourinternetaddress.有会的大神吗？我百度也没有找到原因，下载其他东西的时候也没有报错。	cljcljryry	2019-07-28 12:53
文献求助	QIIME allows analysis of high-throughput community ... Caporaso,J.G.,Kuczynski,J.,Stombaugh,J.,Bittinger,K.,Bushman,F.D.,Costello,E.K.,.&Huttley,G.A.QIIMEallowsanalysisofhigh-throughputcommunitysequencingdata.Naturemethods20107(5),...	lhf903	2018-12-28 12:28
文献求助	QIIME allows analysis of high-throughput community ... Caporaso,J.G.,Kuczynski,J.,Stombaugh,J.,Bittinger,K.,Bushman,F.D.,Costello,E.K.,.&Huttley,G.A.QIIMEallowsanalysisofhigh-throughputcommunitysequencingdata.Naturemethods20107(5),...	lhf903	2018-12-28 12:18
微生物	【分享】第九届中国分子诊断技术大会亮点报告得到的序列利用Ｑｉｉｍｅ软件（Ｑｉｉｍｅ－１．８．０－ｒｅｌｅａｓｅ）进行进一步序列质控，去掉序列的质量值低于某一阈值的序列，参数为默认值；利用ＵＣＨＩＭＥ，...	生物小虫007	2018-11-16 07:39
微生物	利用qiime2进行土壤微生物高通量数据的分析利用qiime2进行土壤微生物高通量数据的分析。我用的是virtualbox下载安装了qiime2.刚开始学习这个。有人知道如何分析吗？原始数据是fastq的，如何进行质控以及后续分析。有没有相应具体的...	liang夏	2018-09-13 03:46
微生物	有没有在qiime2的大神，有问题请教~ 有没有在qiime2的大神，有问题请教~	起名字太难了	2018-07-21 07:38
硕博家园	qiime和qiime2的mapping文件公司测序出来的fasta格式数据，已经去掉了barcode和LinkerPrimerSequence，也质控过了，使用qiime讲数据导入之后一切都还顺利可是到了多样性分析这一步必须使用到mapping文件，qiime2中也是...	干煸四季逗	2018-07-09 02:18
微生物	微生物otu的划分用什么软件做？mega可以吗？查阅到qiime和mothur可以，请问mega和bioedit能不能做otu划分？我看到用mega可以做聚类分析树图，这个图怎么用？聚类分析的树图和otu划分结果有什么关系吗？	peccatum	2018-04-29 02:23
微生物	16s功能预测求助求助大家，土壤样品，送去16s测序的用qiime跑出来的otu表里，有很多是New.CleanUp.ReferenceOTU*这类的OTU，想用picrust进行功能预测，无法识别这部分New.CleanUp.ReferenceOTUs，请问有...	erlaoben	2017-10-02 04:23
微生物	16s rna 如何对otu表进行拉平处理各位好，请问一下，就是我们在做alpha多样性之前，需要对otu表根据最低测序深度进行随机重抽样，即拉平处理，我知道qiime中的parallel_multiple_rarefactions.py可以实现otu矩阵稀疏化，并...	相见很不晚	2017-06-05 01:48
分子生物	数据处理生信小白想请教一下各位大佬，现在主流的qiime版本是哪一个埃	欣琪3572	2017-05-18 08:03
文献求助	求文献。多谢 JesseZaneveld&RobKnightinfo'.1.'][info2]QIIMEallowsanalysisofhigh-throughputcommunitysequencingdatainfo'.2.'][info3]NatureMethods7,335–336(1May2010)\|doi:10....	baopeng	2017-03-15 07:31
文献求助	QIIME allows analysis of high-throughput community ... [info1]JGregoryCaporasoinfo'.1.'][info2]QIIMEallowsanalysisofhigh-throughputcommunitysequencingdatainfo'.2.'][info3]NatureMethodsinfo'.3.'][info4]2010info'.4....	固体物理学	2017-03-03 05:25