应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 微生物otu的划分用什么软件做？mega可以吗？
41/1返回列表
查看: 1332  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

peccatum

新虫 (初入文坛)

[求助] 微生物otu的划分用什么软件做？mega可以吗？ 已有1人参与

查阅到qiime和mothur可以，请问mega和bioedit能不能做otu划分？我看到用mega可以做聚类分析树图， 这个图怎么用？聚类分析的树图和otu划分结果有什么关系吗？

发自小木虫IOS客户端
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2018-04-29 22:40:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peccatum

新虫 (初入文坛)
我是看到这篇文档产生的疑问，该文档中用mega做了聚类，但是我不清楚聚类得出的树图有什么用，怎么用。 文档如下传送门https://wk.baidu.com/view/7ab8cdd152d380eb63946d93.html

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
2楼2018-04-29 22:42:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小冀-: 金币+5, 鼓励回帖应助 2018-05-02 10:00:51
mega不可以做OTU划分，主要是用来建树的，系统树可以得到输入序列之间的亲缘关系，可以用来做OTU的注释（一般用于功能基因OTU），bioedit只是序列查看和对位排列工具，划分OTU主要还是qiime, mothur, usearch/vsearch等软件
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2018-05-02 08:06:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peccatum

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xp198766 at 2018-05-02 08:06:11
mega不可以做OTU划分，主要是用来建树的，系统树可以得到输入序列之间的亲缘关系，可以用来做OTU的注释（一般用于功能基因OTU），bioedit只是序列查看和对位排列工具，划分OTU主要还是qiime, mothur, usearch/vsear ...

我询问了我的老师，他说可以做，我也是蒙蔽了

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
4楼2018-05-04 11:19:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 peccatum 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 8/400 2026-09-01 12:58 by ssyjh
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉？ +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 5/250 2026-08-31 14:40 by hahaboy
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭