应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 微生物otu的划分用什么软件做？mega可以吗？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
41/1返回列表
查看: 1191  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

peccatum

新虫 (初入文坛)

[求助] 微生物otu的划分用什么软件做？mega可以吗？ 已有1人参与

查阅到qiime和mothur可以，请问mega和bioedit能不能做otu划分？我看到用mega可以做聚类分析树图， 这个图怎么用？聚类分析的树图和otu划分结果有什么关系吗？

发自小木虫IOS客户端
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2018-04-29 22:40:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peccatum

新虫 (初入文坛)
我是看到这篇文档产生的疑问，该文档中用mega做了聚类，但是我不清楚聚类得出的树图有什么用，怎么用。 文档如下传送门https://wk.baidu.com/view/7ab8cdd152d380eb63946d93.html

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
2楼2018-04-29 22:42:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小冀-: 金币+5, 鼓励回帖应助 2018-05-02 10:00:51
mega不可以做OTU划分，主要是用来建树的，系统树可以得到输入序列之间的亲缘关系，可以用来做OTU的注释（一般用于功能基因OTU），bioedit只是序列查看和对位排列工具，划分OTU主要还是qiime, mothur, usearch/vsearch等软件
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2018-05-02 08:06:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peccatum

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xp198766 at 2018-05-02 08:06:11
mega不可以做OTU划分，主要是用来建树的，系统树可以得到输入序列之间的亲缘关系，可以用来做OTU的注释（一般用于功能基因OTU），bioedit只是序列查看和对位排列工具，划分OTU主要还是qiime, mothur, usearch/vsear ...

我询问了我的老师，他说可以做，我也是蒙蔽了

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
4楼2018-05-04 11:19:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 peccatum 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 326分，一志愿沪9，求生物学调剂 +4 刘墨墨 2026-04-05 4/200 2026-04-08 06:22 by lijunpoly
[考研] 求调剂 +26 111623 2026-04-04 29/1450 2026-04-08 00:10 by JourneyLucky
[考研] 调剂 +18 不逢春 2026-04-05 19/950 2026-04-07 22:04 by lijunpoly
[考研] 315求调剂 +3 TUZEIQAQ 2026-04-02 3/150 2026-04-07 17:32 by chenp123
[考研] 材料调剂 +12 一样YWY 2026-04-02 14/700 2026-04-07 12:52 by Sammy2
[考研] 362求调剂一志愿中国石油大学 +4 我要考大 2026-04-06 6/300 2026-04-06 14:11 by 无际的草原
[考研] 0703求调剂383分 +9 W55j 2026-04-03 9/450 2026-04-06 06:50 by houyaoxu
[考研] 348求调剂 +6 wukira 2026-04-04 6/300 2026-04-05 18:11 by 猪会飞
[考研] 材料化工306分找合适调剂 +14 沧海轻舟e 2026-04-04 14/700 2026-04-05 09:53 by 朱云虎202
[考研] 材料调剂 +9 革微桂 2026-04-04 9/450 2026-04-05 08:27 by 544594351
[考研] 344材料与化工调剂 +9 调剂上岸玘 2026-04-03 9/450 2026-04-04 23:10 by happyddm
[考研] 342求调剂 +3 Liang7111 2026-04-04 5/250 2026-04-04 19:47 by dongzh2009
[考研] 359求调剂 +7 hhhhaaaa$ 2026-04-04 7/350 2026-04-04 18:49 by imissbao
[考研] 292求调剂 +11 2022080213 2026-04-04 13/650 2026-04-04 18:38 by macy2011
[考研] 材料调剂 +11 吴棂颖！ 2026-04-03 11/550 2026-04-04 09:56 by 小小树2024
[考研] 求调剂 +4 15064154688 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:07 by zrongyan
[考研] 325分化学调剂 +5 15771691647 2026-04-02 5/250 2026-04-03 09:58 by ChemPharm
[考研] 一志愿深大085601材料工程专业（专硕）300分可以调剂去哪 +8 10160315 2026-04-02 8/400 2026-04-03 09:36 by hypershenger
[考研] 08工科求调剂290分 +5 1314捧花 2026-04-02 8/400 2026-04-02 13:16 by 乔哒哒哒
[考研] 材料求调剂 +10 呢呢妮妮 2026-04-01 13/650 2026-04-02 09:17 by olim
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭