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peccatum

新虫 (初入文坛)

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[求助] 微生物otu的划分用什么软件做？mega可以吗？已有1人参与

查阅到qiime和mothur可以，请问mega和bioedit能不能做otu划分？我看到用mega可以做聚类分析树图，这个图怎么用？聚类分析的树图和otu划分结果有什么关系吗？

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1楼 2018-04-29 22:40:23

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引用回帖:

3楼: Originally posted by xp198766 at 2018-05-02 08:06:11
mega不可以做OTU划分，主要是用来建树的，系统树可以得到输入序列之间的亲缘关系，可以用来做OTU的注释（一般用于功能基因OTU），bioedit只是序列查看和对位排列工具，划分OTU主要还是qiime, mothur, usearch/vsear ...

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