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分类 共搜索到 41 个相关话题(最多显示前5000个) 作者 最后发表
硕博家园 请问哪位大神有DOTUR或者是mothur软件
请问哪位大神有DOTUR或者是mothur软件,能发我一份嘛?谢谢!'627653042qq.com'
阿艺小可爱 2019-06-26 01:16
程序语言 Mothur如何把两批不同长度的序列按照短的那批截成一样长度
两批数据引物不同,可以放在一起分析吗?
耶耶耶耶耶123 2018-08-31 01:48
微生物 微生物otu的划分用什么软件做?mega可以吗?
查阅到qiime和mothur可以,请问mega和bioedit能不能做otu划分?我看到用mega可以做聚类分析树图,这个图怎么用?聚类分析的树图和otu划分结果有什么关系吗?
peccatum 2018-04-29 02:23
分子生物 跪求Silva 115 18S 真核生物数据库
'https://mothur.org/wiki/Silva_reference_files'如题Mothur上已经下载不到115了,想和之前的分析作比较,跪求哪位之前下载下载过了,赐Silva115给我,万分感谢。
geniusrkx 2017-10-26 01:25
生物科学 mothur 路径求助
下载了一个在Mac上免安装可直接用的mothur,之前把需要处理的数据放在application/mothur目录下,运行计算的时候结果都是:Unabletoopenseqman.fasta.Tryingdefault/Applications/mothur/...
neuzxy1102 2017-08-11 01:01
资源求助 求助会mothur,r软件的大神
现要使用mothur和r软件进行画图,但是我零基础,现在连软件也安装不成功,希望广大的小木虫虫友们伸出援手给我推荐一些学习的书或者视频课程,我将万分感谢![发自小木虫android...
鬼笔画图 2017-05-03 03:47
程序语言 align.seqs命令问题
请教大家一个问题,我用align.seqs命令时候,运行结果总是出现,errorinreadingyourfastafile,atposition-1,Blankname………这个是什么情况?我用的是mothur这个软件。如下图
LY1199 2017-04-17 05:29
微生物 用过mothur的进来聊聊,求助!
输入0.01反馈的就是0.01输入0.02反馈的是0.020.01输入0.05反馈的是0.010.020.030.04输入0.06也是直接跳过0.05!奔溃了!
xiaoxie2020 2016-12-08 10:13
分子生物 mothur的进来!为什么只有cutoff 0.05算不了?
输入0.01反馈的就是0.01输入0.02反馈的是0.020.01输入0.05反馈的是0.010.020.030.04输入0.06也是直接跳过0.05!奔溃了!
xiaoxie2020 2016-12-08 10:37
电脑软件 Mothur最新版本,Windows和Linux版。
Mothur最新版本,Windows和Linux版。
无知的小强 2016-11-03 01:15
分子生物 Mothur和qiime平台计算的Alpha多样性指数不一样
经比较分析后发现Mothur和qiime里平台simpson指数的计算公式不一样。同一组数据用qiime(alpha_diversity.py)处理后shannon和simpson指数成正相关,而mothur的处理结果成负相关。有没有童鞋...
burubenpao 2016-06-02 05:21
分子生物 一代测序后的序列用什么软件划分OTU
请教一代克隆测序后拿到200个序列,用什么软件进行OTU分类?在网上搜索都说用Dotur或者Mothur,可是这两个软件都不会用,也下载不到。有没有比较简单的窗口操作的软件?DNAman可以吗?谢谢
dakongy1987 2016-05-02 01:13
微生物 mothur
各位老师想问一下在winSCP上运行mothur软件分析微生物怎样采用后台提交任务的形式?
tankoer 2016-03-08 02:06
微生物 mothur软件安装不成功
g+-O3-DBIT_VERSION-DRELEASE_DATE=""7/27/2015""-DVERSION=""1.36.1""-DUSE_READLINE-DUSE_BOOST-I.-Isource/-Isource/calculators/-Isource/chimera/-Isource/classifier/-Isource/...
tankoer 2015-12-30 10:32
微生物 mothur做植物内生真菌基因库的OTU聚类分析,提示片段长度不...
想用mothur软件把这些序列划分到不同的OTU,然后再挑选每个OTU中代表序列做系统发育分析。那么问题来了?我在运行mothur软件时,提醒序列长度不一致,需要修改成一致的。请问这个是什么意思...
wcq吴超群 2015-12-09 02:01
硕博家园 mothur得到的数据,怎么做图?
mothur分析后得到的数据,可以继续用QIIME做图吗?谢谢!
valleyluxj 2015-11-23 09:34
生物科学 QIIME-16s测序生物信息培训课程(原创)
pick_open_reference_otus.pypick_otus.py-从fasta文件中提取OTUs,提取方法有cd-hit,blast,Mothur,usearch。make_otu_table.py-将提取出的OTUs制作成out_table,即.biom文件。assign_...
学员KgpCIM 2015-08-31 03:21
微生物 求LINUX系统的MOUTHUR软件
想在LINUX系统的计算机上安装MOUTHUR软件,在mothur主页上一直没有找到安装的软件,求大神发个给我,谢谢!'xiaowei9695163.com'
xiaowei9695 2015-04-06 02:46
资源求助攻关(高悬赏) 求高通量拼接软件velvet、mothur软件包、BioLinker 自编程序,...
求高通量拼接软件velvet、mothur软件包、BioLinker自编程序,谢谢!
wenhuoyeying 2015-03-04 12:20
生物科学 运行mothur的tirm.seqs命令后,mothur出现问题,强行关闭是为...
如题
dawn_destiny 2014-12-02 10:27
微生物 Mothur软件
各位大侠好,小女子初学微生物群落结构分析,借宝地求Mothur软件一用。不知哪位大侠有此宝物?小女子在此谢过各位大侠啦!如果各位大侠有用Mothur来进行OTU分析及稀释曲线制作的详细步骤,...
jingyi_180 2014-11-15 03:14
分子生物 mothur做多个样品的稀释曲线
怎么用mothur做多个样品的稀释曲线,求具体流程和相关命令,求大侠指教,不甚感激!
wang4681060 2014-11-09 04:49
分子生物 ta克隆后的otus划分!
大家好,上个月从出去一个样品进行ts克隆,现在收到50个序列,要用mothur检测分类操作单元(otus)。但是我电脑不是win系统,而且我也没做过,这几天就要交结果,又可以帮忙下的么!
ciceyh 2014-11-03 12:11
分子生物 Mothur可以根据氨基酸序列划分OTU吗?
请问Mothur可以根据氨基酸序列划分OTU吗?我用氨基酸序列分析的时候,出现下面这句话,请问是什么情况啊?求大神指导“Wefoundmorethan25%ofthebasesinsequence。tobeambiguous....
snmrna 2014-06-15 04:37
微生物 用Exce或其他软件处理Mothur数据做稀释曲线rarefaction curve
mothur软件初学者.电脑盲,借之前帖子数据重发求助帖。用excel或者其他软件怎么样才能做出来稀释曲线呢?897557_1337242328_347.jpg
kittykbh 2014-04-14 09:11
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