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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » ta克隆后的otus划分！
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ciceyh

新虫 (初入文坛)

[求助] ta克隆后的otus划分！已有1人参与

大家好，上个月从出去一个样品进行ts克隆，现在收到50个序列，要用mothur检测分类操作单元（otus）。但是我电脑不是win系统，而且我也没做过，这几天就要交结果，又可以帮忙下的么！
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1楼2014-11-03 20:01:11
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阿图迪图

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-11-04 18:57:32
mothur有各种操作系统的版本吧，下一个对应版本呗
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2楼2014-11-03 20:03:44
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ciceyh

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 阿图迪图 at 2014-11-03 20:03:44
mothur有各种操作系统的版本吧，下一个对应版本呗

划分otus一般都是用mothur吗？
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3楼2014-11-03 20:56:37
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阿图迪图

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by ciceyh at 2014-11-03 20:56:37
划分otus一般都是用mothur吗？...

序列少用mothur和dotur都可以。
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4楼2014-11-03 21:40:11
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ciceyh

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 阿图迪图 at 2014-11-03 21:40:11
序列少用mothur和dotur都可以。...

晕，弄了好久都没弄好，mothur下好了，但是那个序列好像要弄成fasta格式的，我直接改后缀名好像不行。同学可以帮下忙帮我弄下吗？
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5楼2014-11-04 01:04:53
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ciceyh

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 阿图迪图 at 2014-11-03 21:40:11
序列少用mothur和dotur都可以。...

我otu弄好了，但是不同otu里面的菌blast出来后是一样的？这怎么办
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6楼2014-11-04 22:02:21
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