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分类 共搜索到 82 个相关话题(最多显示前5000个) 作者 最后发表
计算模拟 Modeller安装后找不到打开程序
我按照网上的说明在官网上下载了modeller,并申请了激活码,但是安装后找不到打开程序的那个exe程序,这是为什么呀?该怎么解决?
药化刘 2021-12-09 11:45
硕博家园 Modeller9.24安装
modeller9.24的安装秘钥tuzi3:
赵! 2021-09-11 11:14
招聘信息布告栏 【招聘】分子模拟/计算化学研究员
2、熟练使用autodock、gold、modeller、amber、gaussian等的其中一种或多种;3、熟练运用ncbi、pdb、uniprot等数据库进行项目立项调研与分析;4、以第一作者发表过分子模拟sci论文的优先;5...
fisb0637 2021-01-22 02:40
招聘信息布告栏 硅康医药科学计算团队诚聘英才
5.熟悉结构生物学中的一个或多个软件工具,例如o,rosetta,modeller,pymol,vmd,amber等。具备以下条件者尤佳:1.基于结构的药物设计研究经验2.熟练掌握一种或多种编程语言(python尤佳...
SILICONTX 2020-04-14 02:15
休闲灌水 同源建模
我需要构建2个亚基的蛋白3D模型,可是采用modeller单模板建模建3D模型,只构建出一个亚基,想请教一下这是什么原因?
5215娜娜 2019-11-12 09:36
硕博家园 关于modeller
请问蛋白质结构预测软件modeller,它使用的序列比对是什么算法,或者是用的什么程序
红豆,大红豆 2019-10-22 04:49
分子模拟 有没有大神知道这些软件分别是主要用来干什么的吗?
hex-6a-win、iGEMDOCK、modeller、YASARA、AutoDock每个软件主要是用来做什么的?求大神指导一下,谢谢。
坤哥不嗨 2019-06-29 06:00
分子模拟 [AMBER]Error in Box Dimension
各位大神大家好:我是一个Amber初学者,我的体系是蛋白+膜+水的盒子体系,蛋白是β2AR主体来自晶体2RH1,但是我用Modeller补全了长32个残基的ICL3区域,膜是POPC,水层厚度一开始是12?。...
qcy6830100 2019-06-25 09:48
招聘信息布告栏 【招聘】分子模拟计算化学研究员
2、熟练使用autodock、gold、modeller、amber、gaussian等的其中一种或多种;3、熟练运用ncbi、pdb、uniprot等数据库进行项目立项调研与分析;4、以第一作者发表过分子模拟sci论文的优先;5...
沙漠猎人 2019-05-22 06:52
分子模拟 同源模件-分子对接
modeller构建的蛋白结构,无法用schrodinger(maestro)进行准备的情况。在H-bondassingment时一直不出结果,运行了20几个小时
52songshuang 2019-03-13 05:04
硕博家园 蛋白结构同源模建
大家有没有遇到过用modeller构建的蛋白结构,无法用schrodinger(maestro)进行准备的情况。在H-bondassingment时一直不出结果。运行了20多个小时
52songshuang 2019-03-13 04:43
生物科学 modeller
已有三维结构的蛋白质,采用modeller比较后后,选出最优的蛋白,在通过modeller建模后,在pymol中看到产生的蛋白三维结构与最优蛋白结构的三维结构很接近(大抵重合),但是在pymol这些最优...
牙牙爱学 2018-12-31 10:39
分子模拟 modeller的注册码
怎么注册modeller,谁能帮忙弄一个,多谢多谢
初学者4396 2017-09-18 12:08
分子模拟 chimera同源modeller以后,如何保存模板中含有的ATP结构
请问用过chimera的,我在内嵌的同源后,由于同源建模的模板结构中含有ATP,如何把建模结果中的蛋白和ATP一同保存下来,各种尝试及看说明过后只能保存蛋白部分,而ATP没一同保存下来,谢谢了
ccyykk33 2017-07-13 12:46
计算模拟 modeller无限闪退
modeller9.9无限闪退,根本没法用,win7和winxp虚拟机都不行。
j912028451 2017-03-29 07:00
分子模拟 modeller做蛋白质建模过程中遇到问题
建模小白一只,打开modeller是Dos界面,输入mod9.16后没有什么反应,不知道第一步该怎么做
雪野千树 2017-01-30 01:57
分子模拟 同源模建
所以我就在swiss-modeller上直接用我之前搜到的人的BCRP序列,找模版。这之后会找到几个模版,相似度也就30%,这样的话可以直接用这些模版来建模,但是这样的话之前pblast又有什么用了呢?...
hanzhongjie 2016-11-09 03:58
分子模拟 新手关于easy modeller的问题,求大神解决
安装好modeller和easymodeller之后,打开easymodeller之后,点击那个弹出的ok之后就闪退了,求助是什么问题,最好是再有点用easymodeller的经验
阿狸1205 2016-04-07 07:22
程序语言 跪求modeller大神!
跪求modeller大神帮忙
纯帅特种兵 2016-01-15 07:53
分子模拟 求问各位大神,怎么将两条建好的蛋白链拼在一起形成异源二聚体啊...
我用modeller建了两条蛋白链,但是现在遇到了问题,就是要怎么把两条链拼在一起形成异源二聚体呢?在modeller脚本有看到frommodellerimport*frommodeller.automodelimport*#...
yxqfzc 2015-11-24 07:37
分子模拟 关于蛋白同源建模的一些问题
分子建模的时候我是使用SWISSMODEL还是使用本地的MODELLER建模更好3.建模的时候我是使用单一高序列一致性的单一模板还是考虑同时使用多个同源模板建模小弟目前遇到以上一些问题,还望诸位...
策马入林 2015-10-18 02:59
文献求助 Modeller:generation and refinement of homology-based protein...
Sali,Andrejinfo'.1.'][info2]Modeller:generationandrefinementofhomology-basedproteinstructuremodels.info'.2.'][info3]Methodsinenzymologyinfo'.3.'][info4]2003...
cheor3war 2015-10-05 04:53
分子生物 Discovery Studio(DS)蛋白建模
使用MODELLER产生目标序列的模型5.模型的评估本教程中以一个胞外淀粉酶的模型构建过程为例子,展示如何使用DS为该淀粉酶自动构建空间结构,并对所构建的模型进行评估,帮助大家获得...
earth王胜利 2015-06-26 12:55
微生物 关于easy modeller 的使用问题
在进行序列比对时候,出现了如图片所示问题,希望各位大神给予指点!6[J[($7~SQ5A$78S26I5FS.jpg
fxchen1990 2015-05-29 01:34