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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 同源模件-分子对接
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52songshuang

铁虫 (正式写手)

[求助] 同源模件-分子对接 已有2人参与

用modeller构建的蛋白结构，无法用schrodinger（maestro）进行准备的情况。在H-bond assingment 时一直不出结果，运行了20几个小时
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1楼 2019-03-13 13:03:04
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52songshuang

铁虫 (正式写手)
大神这是什么原因

发自小木虫Android客户端
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2楼2019-03-13 13:27:31
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扯不断

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

检查下蛋白pdb文件，用文本编辑器打开，清除无用信息（除了MODEL、ATOM、HETATM、END、ENDMDL开头的行），保存后再试试。实在不行，用殷赋云计算平台的分子对接方案（http://www.yinfotek.com/platform），人性化设计、智能处理，小白、专家都在用。
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3楼2019-03-25 10:54:11
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闲花落笔
引用回帖:
3楼: Originally posted by 扯不断 at 2019-03-25 10:54:11
检查下蛋白pdb文件，用文本编辑器打开，清除无用信息（除了MODEL、ATOM、HETATM、END、ENDMDL开头的行），保存后再试试。实在不行，用殷赋云计算平台的分子对接方案（http://www.yinfotek.com/platform），人性化设 ...

棒

发自小木虫IOS客户端
4楼2019-03-25 11:04:07
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一代米哟

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

可以用【处理PDB结构】小工具处理下，百度搜索看看吧。
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5楼2021-12-03 16:22:28
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