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作者
最后发表
量子化学
怎么基于STEOM-DLPNO-CCSD计算rISC
3.最后,最重要的步骤计算risc:a)是用手册中提供的例子作为输入文件(td-dft),将上述td-dft得到的s1-t1结构和
hessian
,steom-dlpno-ccsd得到的能量,写入如下输入文件中来计算?...
hcmzj668
2024-11-25 04:30
计算模拟
gaussian的约化质量是怎么算出来的
请教各位老师同学,gaussian的约化质量是怎么算出来的?我知道力常数是质权
hessian
矩阵的特征值开根号得来的。beefly月只蓝
18366
2024-11-12 11:19
文献求助
Normal-mode analysis without the
Hessian
:A driven molecular-...
JoelM.Bowman;XiubinZhang;...646–650...
liboiaswhu
2023-08-13 08:13
计算模拟
INCAR详解2
支持
Hessian
和Freq(仅Г点)的计算以及部分固定的MD?????详细的要在示例中具体情况具体分析了。?????ISIF?calculate?stress?and?what?to?relax?????Default?if?...
A宝禄计算
2023-06-07 08:20
数理科学综合
离散方法计算导数
那么deltaz需不需要也比deltax大很多之类的,谢谢2生成了JacobianHessian矩阵后,怎么样可以生产一个比较理想(非线性优化最小函数)的新解(扰动解)能否用旧解+系数.*
Hessian
的逆矩阵.*...
chevyyang
2021-08-10 08:24
计算模拟
怎么把phonopy的FORCE_CONSTANTS文件转换为force_constants.hdf5...
在计算拉曼光谱时,我最开始先在vasp里计算
Hessian
矩阵。然后通过phonopy读取vasprun.xml文件中的力学常数。使用的是“phonopy-fcvasprun.xml”,这个时候就会生成一个FORCE_CONSTANTS的...
Chimahoo
2021-07-19 07:49
第一性原理
Phonopy怎么把从vasprun.xml中得到的FORCE_CONSTANTS文件转换为....
在计算拉曼光谱时,我最开始先在vasp里计算
Hessian
矩阵。然后通过phonopy读取vasprun.xml文件中的力学常数。使用的是“phonopy-fcvasprun.xml”,这个时候就会生成一个FORCE_CONSTANTS的...
Chimahoo
2021-07-19 07:38
第一性原理
请问phonopy算出来的声子谱杂乱无章怎么办,是什么原因
如题,就是很普通的vasp算出来的
hessian
矩阵,然后用phonopy计算一下,但是声子谱和文献上的平滑的,我的就噪声很多。不知道为什么传不了图片,所以就不放图了。ATOM_NAME=CDIM=111...
气流C
2021-03-22 12:13
第一性原理
读取力常数矩阵(
Hessian
)后,怎么读取原子顺序?
从MS的.xsd文件里读出
Hessian
矩阵H_ij后,需要求F_ij=H_ij/√(m_i*m_j),然后求本征值。但是题主不知道
Hessian
矩阵对应的原子质量m_i。晶体makeP1后,xsd中列出的原子的顺序好像和
hessian
的...
Leo26
2019-03-25 02:54
文献求助
J.of Biomedical Optics,
HuangxuanZhao,GuangsongWang,RiqiangLin,XiaojingGong,LiangSong,TanLi,WenjiaWang,KunyaZhang,XiuqingQian,HaixiaZhang,LinLi,ZhichengLiu,ChengboLiuThree-...046006(2018)....
zzuguobing
2018-11-15 09:04
第一性原理
海森矩阵和简正坐标的通俗解释
2)很多情况下,我们只要知道物理意义便可,在波恩奥本海默近似的框架下,在平?点附近分子势能对坐标展开的
hessian
矩阵(其实就是二阶导数)的特征值是有物理意义的,对应在谐振子近似下...
shuligaoshou
2018-10-27 08:36
文献求助
The role of the
Hessian
matrix in fitting models to ...
[info1]WilliamCarlisleThackerinfo'.1.'][info2]Theroleofthe
Hessian
matrixinfittingmodelstomeasurementsinfo'.2.'][info3]journalofgeophysicsresearchinfo'.3.']...
zaq123321
2017-11-05 09:27
第一性原理
声子计算时NPAR设置
各位大侠,请问下用VASP采用DFTP方法计算
Hessian
矩阵时,选用的是IBRION=8,IALGO=38,设置NPAR后,计算老提示报错,提示:|VASPinternalroutineshaverequestedachangeofthek-pointset.|...
hunter2010
2017-10-10 12:16
文献求助
Changes in properties of wheat leaf ...with
Hessian
fly
Hessian
fly.info'.2.'][info3]《PlantJournalforCell&MolecularBiology》info'.3.'][info4]2010info'.4.'][info5]63(1):31–43info'.5.'][info8]ScienceDirect(Elsevier)...
changchg
2017-10-10 07:05
文献求助
紧急求助
[info1]ByrdRH,NocedalJ.info'.1.'][info2]Analysisofreduced
hessian
methodsforconstrainedoptimizationinfo'.2.'][info3]NumericalProgramminginfo'.3.'][info4]1991...
冷千山
2017-07-31 01:47
第一性原理
如何在Dmol3计算固体表面吸附分子的自由能中用Partial
Hessian
...
即只对吸附分子做频率分析,基底原子自动忽略,最后给出零点能和室温下的自由能。这样可以极大的降低计算量。尝试发现vasp和castep可以通过对基底原子固定坐标的方式来做到这个效果。...
clickme
2017-06-28 04:11
第一性原理
DMol3计算虚頻问题
用DMol3优化一个周期性体系,在优化的基础上,又算了...将.
hessian
文件导入到结构文件,分析振动模式,vibrationalanalysis却不显示那三个小的虚頻。这种情况该怎么判断这三个虚頻是否处理。
acnes
2017-04-27 12:55
量子化学
gamess算
hessian
错误提示
请问gamess算
hessian
时出现如下情况是什么原因,应该如何解决?我主要是想从
hessian
中得到零点能,出现这种情况,得到的零点能还可靠吗?360截图20170227105105571.jpg
zpk1120
2017-02-27 02:26
量子化学
gaussian计算过渡态的原理是怎么样的?
是不是gaussian也会自己改变结构(自己设定路径)来确定
hessian
矩阵中的负值(找到虚频)。和采取scan的方式寻找过渡态相比,gaussian是不是不在自己改变结构,而是依据设定键长(键角)的...
xiayu1985
2017-02-11 05:33
有奖问答
多元函数的
Hessian
矩阵的特征向量体现了这个多元曲面的什么信息...
如题,我猜是曲面局部的两个主要扩散方向,但是不知道如何具体说明这个问题
douzeyang
2016-08-15 06:32
文献求助
Wiley 文献一篇
Hiraoinfo'.1.'][info2]artial
hessian
fittingfordeterminingforceconstantparametersinmolecularmechaninfo'.2.'][info3]journal.compt.chem.info'.3.'][info4]First...
ziyue_pony
2016-08-08 11:56
量子化学
什么是
Hessian
calculations?用gaussian怎么算?
急救:审稿人问idtheauthorsperformHessiancalculationstoensuretheyhaveoptimizedtrueminima?1.哪位gaussian大侠能回答一下什么是Hessiancalculations?2.确定优化到最低点一定要用...
xzh410512206
2016-07-23 12:08
分子模拟
求助:如何在分子动力学中计算normal mode frequency,比如冰的...
就是在T=0K时,进行能量最小化,然后得到
hessian
再对角化?那么对于冰这种体系,可以得到多少个frequency呢?取3个最大的吗?
Janetwx
2016-04-25 04:06
文献求助
msp.org 数据库求助一篇
estimatesforcomplex
Hessian
equationsinfo'.2.'][info3]Analysis&PDEinfo'.3.'][info4]2014info'.4.'][info5]Vol.7(2014),No.1,227–244info'.5.'][info6]10.2140/apde.2014....
smileyangel
2016-03-27 07:21
第一性原理
求问层间距计算过大
update_inv_
hessian
_paramsgeom_update_inv_Hessiangeom_BFGSgeometry_optimisecastepLastknownprocessinformation:=Name:castepexe.exeState:R(running)Tgid:48849Ngid:0Pid:48849PPid:...
w2056275
2016-03-27 06:42
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