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分类	共搜索到 32 个相关话题(最多显示前5000个)	作者	最后发表

导师招生	招博士，申请考核制，环境化学、环境毒理/健康方向 211院校，现需要招一名从事环境化学（污染物迁移转化）、环境毒理/健康方向的博士，擅长机器学习、生信分析、分子对接、分子动力学模拟、分子计算模拟软件（VASP、MS、DS、cdocker、CP2K、...	21018060	2025-10-28 12:21
分子模拟	Ds分子对接 CDOCKER完成之后，状态显示成功，但是查看不了结果，显示有错误，想请教一下大佬们怎么解决。因为发不了照片，出现的error内容如下Error:theoperationfailed-errordosenotesit.atfileline23...	玄呀呀呀	2023-03-05 08:22
分子模拟	分子对接 DS 想问下各位大佬，想对一个分子库进行分子对接（CDOCKER），大约1600多个分子，请问下有具体流程吗	玄呀呀呀	2022-11-03 11:14
分子模拟	CDOCKER 用DS对接总是显示failedligands，求助各位大神帮帮我～oxox6085smutao	liuj2020	2021-07-18 03:41
分子模拟	DS一直实在running状态各位大神求助个问题，最近再用DS做对接的时候，不论是用cdocker还是柔性对接，及其一直实在running状态，之前十几分钟能做完的，现在十几个小时了还在running，不知道是怎么回事？...	huantao12	2021-06-21 02:58
分子模拟	急急急 DS 有1500个配体小分子，3个靶标蛋白，怎么用DS的CDOCKER实现快速对接，快速对接或者用其他方法也行	潇潇％	2019-03-18 02:07
计算模拟	ds对接筛选用ds做药物筛眩只做水溶性和cdocker够不够，还需要看哪些参数，谢谢	好的幸福	2017-03-30 11:24
分子模拟	CDocker Energy 为负，怎么回事用DS中CDocker分子对接，但结果-CDockerEnergy为负是什么原因？怎样解决	Mr.lovein	2016-10-16 01:37
分子模拟	DS对接可以将确定的氨基酸残基作为共价键位点么如题，CDOCKER对接对接不到文献给出的作用位点，可以先预设么	精业济群	2016-04-01 02:11
分子模拟	DS-分子对接求助各位大虾：利用DiscoveryStudio中CDOCKER和LibDock做分子对接研究，如果采用默认参数，晶体复合物中配体分子对接回原蛋白后得不到较好的结果，一般会修改哪些参数呢？谢谢！	珍维永久	2015-09-14 07:38
分子模拟	DS做多亚基蛋白分子动力学模拟的问题大家好，现在要研究一个六聚体蛋白与配体的结合，但是同源建模时只建了其中一个亚基，并用CDOCKER进行配体与蛋白对接。这样的单亚基蛋白再做分子动力学模拟是否很不准确？是否要再构建六聚...	dingding9631	2014-10-27 01:00
分子模拟	CDOCKER之前是不是要先用libdock？看创腾的教程，CDOCKER的时候配体分子已经出现在了蛋白结构里面，那是不是已经做了一轮libdock？	biogefart	2014-06-20 01:49
分子模拟	请教如何CDOCKER或者其他方法对接核糖体亚基各位虫友，是否有人对接过30sRNA或50sRNA，小分子如何跑进又有蛋白又有RNA的体系里呢？在我的对接过程中，虽然能够跑成功，但是不管怎么选择位点，都是0pose~就算选择PDB中已对接完成的体系...	ge_hongmin	2014-05-09 03:07
分子模拟	ds opose 用DS做分子对接时，把蛋白晶体...在新窗口粘贴，加氢，赋予力场cdocker参数都按照讲义设置的，对接的结果是0pose谁能帮我看看，问题出在哪里，球的大小都改了试了N变还是不行，实在没辙了。	caidong0804	2013-11-27 12:41
分子模拟	12月4-6号沈阳药科大学Discovery Studio 培训班 CDOCKER基本原理介绍、案例分析11:45-13:30午餐13:30-14:45基于受体药物设计之药物作用机理研究-CDOCKER参数设置意义、实际操作技巧及结果分析14:45-15:00茶歇15:00-16:00基于受体药物设计...	zhangjizeng	2013-11-14 07:04
分子模拟	DS2.5问题求助使用DS2.5进行分子对接时，如何评价libdock，ligandfit以及CDOCKER对接结果的好坏？使用libdock进行分子对接时，如何在对接结果中看RMSD值？	张学升	2013-10-10 04:10
分子模拟	请问怎么对DS中的对接结果进行分析呢？ Activesites12345678910-CDOCKER_ENERGY30.282825.919931.798928.032827.988333.267717.428912.956518.447917.2836-CDOCKER_INTERACTION_ENERGY36.981132.815138.43535.668335.284141....	Qeason	2013-06-14 10:01
分子模拟	DS中如何分子批量能量优化? DS在进行CDOCKER前需要做分子能量优化吗？我想问一下，如果要批量对配体分子进行能量优化,要怎样操作？谢谢	zhouzhiguang	2012-10-16 06:37
分子模拟	我想用SYBYL的对接后的体系去做DS的QM/MM优化模型，跑一个MD? 目前我已经用CDOCKER(DS)以及Surflex-dock和AUTODOCK三种方法进行对接发现Sulflex-dock的对接结果比较好（就是比较适合我的这个体系）。现在就是有这样一种想法，用SYBYL的对接，再用DS的QM...	zhouzhiguang	2012-10-14 06:10
分子模拟	DS3.1的tools中没有dock的libdock和cdocker 我安装了ＤＳ３.０，要做ＴＧＦｂｅｔａ与1ktz的对docking，但是我的tools下面怎么没有关于docking的工具呢？我安装DS后，文件有400多M，是不是差什么东西呀！求高手们指点，谢谢！...	lb83074nx	2012-03-30 01:20
分子模拟	DS做CDOCKER问题请教用DS的CDOCKER做对接，对结果的评价主要看哪几个参数，具体值是大还是小的好？本人初涉此行，望各位高人不吝赐教，万分感激！	yu15742837	2012-03-24 03:03
分子模拟	DS 做CDOCKER结果中如何标注蛋白质残基的名称及序列编号如题文献报道有残基名称及编号，我怎么无法弄出来，菜鸟级，请多多指教。'http://edu.emuch.net/attachment/fd/95/824097_1327725551_606.jpg'[Lasteditedbyshidahuaon2012-1-28at12:44]	shidahua	2012-01-28 04:07
分子模拟	DS2.5中CDOCKER模块对接的问题最近在使用DS2.5进行分子对接的时候出现过这样的问题。对接结果为0poses，提示的错误信息为：Norefinedposesfoundforligand*.也曾询问过原因，说是对接球的位置和半径不正确，可以尝试着...	wangyan10	2011-12-12 07:48
分子模拟	关于DS中的Cdocker 在用CDOCKER做nativedocking时，为什么对接出来结果的配体构象和原来晶体配合物中的配体构象是反的？原来以为是给蛋白做了优化的原因，后来蛋白没有做优化，只是加了力场，结果还是反的，...	wxwsunny87	2011-11-24 01:11
分子模拟	分子对接后的cdocker_energy为负值，肿么办？我遇到个问题就是，-cdocker_energy为负值，也就是对接能量为正值技术说可以优化后再做对接可是优化后没有什么变化。	see_uok	2011-07-25 02:56