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封印一

新虫 (小有名气)

[求助] MOF孔道内定了些水分子，审稿人让propose a realistic model 是什么意思

求助各位虫友，我有一个MOF，是在水和DMF中合成的，晶体精修时DMF可以定出来，剩下比较多的较大的Q峰，定为了氧，没有加氢，
就是认为是水分子，热重分析和元素分析也能对应的上，现在审稿人给出了意见：Moreover, despite quite good agreement factor, both structure presents a lot of oxygen atoms used to fit the residual density inside the MOF channel along the a axis. It is necessary to propose a realistic model for the filling of these channels, based on identified chemical compounds. 实现不明白这个“propose a realistic model for the filling of these channels‘’应该怎么做呢？还请各位同行给答疑解惑，谢谢。@lich666@jackdeng
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1楼2022-05-05 16:02:21
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封印一

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by SAFEEEE at 2022-05-09 18:18:49
把晶体图放上才能看出问题，光描述看不出问题，估计是椭球不正常。
...

图已经上了，氧原子没有各向异性精修，请帮忙看一下，这样处理有没有问题
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5楼2022-05-11 09:45:23
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SAFEEEE

木虫 (正式写手)
要放图，是不是水处理的方式不对？

发自小木虫IOS客户端
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2楼2022-05-05 18:21:42
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封印一

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by SAFEEEE at 2022-05-05 18:21:42
要放图，是不是水处理的方式不对？

正文的图里没加溶剂，在SI文件中放了加入溶剂分子的框架图，水分子就是把残留的大的Q峰定为O原子，没有加氢，占有率也是人为定的 0.5 或者 0.25,。
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3楼2022-05-09 11:38:01
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SAFEEEE

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 封印一 at 2022-05-09 11:38:01
正文的图里没加溶剂，在SI文件中放了加入溶剂分子的框架图，水分子就是把残留的大的Q峰定为O原子，没有加氢，占有率也是人为定的 0.5 或者 0.25,。...

把晶体图放上才能看出问题，光描述看不出问题，估计是椭球不正常。

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4楼2022-05-09 18:18:49
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