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封印一

新虫 (小有名气)

[求助] MOF孔道内定了些水分子,审稿人让propose a realistic model 是什么意思

求助各位虫友,我有一个MOF,是在水和DMF中合成的,晶体精修时DMF可以定出来,剩下比较多的较大的Q峰,定为了氧,没有加氢,
就是认为是水分子,热重分析和元素分析也能对应的上,现在审稿人给出了意见:Moreover, despite quite good agreement factor, both structure presents a lot of oxygen atoms used to fit the residual density inside the MOF channel along the a axis. It is necessary to propose a realistic model for the filling of these channels, based on identified chemical compounds. 实现不明白这个“propose a realistic model for the filling of these channels‘’应该怎么做呢?还请各位同行给答疑解惑,谢谢。@lich666@jackdeng
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SAFEEEE

木虫 (小有名气)

要放图,是不是水处理的方式不对?

发自小木虫IOS客户端
2楼2022-05-05 18:21:42
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封印一

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by SAFEEEE at 2022-05-05 18:21:42
要放图,是不是水处理的方式不对?

正文的图里没加溶剂,在SI文件中放了加入溶剂分子的框架图,水分子就是把残留的大的Q峰定为O原子,没有加氢,占有率也是人为定的 0.5 或者 0.25,。
3楼2022-05-09 11:38:01
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SAFEEEE

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 封印一 at 2022-05-09 11:38:01
正文的图里没加溶剂,在SI文件中放了加入溶剂分子的框架图,水分子就是把残留的大的Q峰定为O原子,没有加氢,占有率也是人为定的 0.5 或者 0.25,。...

把晶体图放上才能看出问题,光描述看不出问题,估计是椭球不正常。

发自小木虫IOS客户端
4楼2022-05-09 18:18:49
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封印一

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by SAFEEEE at 2022-05-09 18:18:49
把晶体图放上才能看出问题,光描述看不出问题,估计是椭球不正常。
...

图已经上了,氧原子没有各向异性精修,请帮忙看一下,这样处理有没有问题
5楼2022-05-11 09:45:23
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封印一

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 封印一 at 2022-05-11 09:45:23
图已经上了,氧原子没有各向异性精修,请帮忙看一下,这样处理有没有问题...

终于把图上传上来了。。
MOF孔道内定了些水分子,审稿人让propose a realistic model 是什么意思
6楼2022-05-11 09:56:46
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SAFEEEE

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 封印一 at 2022-05-11 09:56:46
终于把图上传上来了。。
...

明显不对,需要做无序。

发自小木虫IOS客户端
7楼2022-05-11 18:16:52
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qq1063906085

金虫 (小有名气)

估计审稿人想让你根据晶体中氧原子的位置,大致推测一下,水分子在孔道中的排列情况。类似于像下面文献这样。
Hanikel, N.; Pei, X.; Chheda, S.; Lyu, H.; Jeong, W.; Sauer, J.; Gagliardi, L.; Yaghi, O. M. Evolution of water structures in metal-organic frameworks for improved atmospheric water harvesting. Science 2021, 374, 454-459. DOI: doi:10.1126/science.abj0890
8楼2022-05-11 19:03:28
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