应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何确定一个蛋白在目标菌株中的同源蛋白？
51/1返回列表
查看: 2435  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

baierlug

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何确定一个蛋白在目标菌株中的同源蛋白？ 已有1人参与

已知E.coli的一个蛋白A，我想找到在我的菌里面的同源蛋白，请问如何确定哪个是其同源蛋白？
我把A的氨基酸序列进行blastp比对，目标菌株选定我的菌后，得到的结果如图所示，有很多个蛋白，请问哪个才是A的同源蛋白？如何确定的？谢谢！！

如何确定一个蛋白在目标菌株中的同源蛋白？
FireShot Capture 4 - NCBI Blast_Protein Sequence (490 let_ - http___blast.ncbi.nlm.nih.gov_Blast.cgi.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
嬉皮之下尽是忧伤
1楼 2016-02-24 12:36:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baierlug

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sunlk at 2016-02-24 14:13:46
同源性是一个定性的概念，我觉得你可以选择跟你序列一致性比较高的基因，即第一个。

是的两个蛋白要么是同源的，要么不是同源蛋白。基本确定第一个是，问题是我不知道第二个第三个等等是不是也是同源蛋白？怎么确定的
赞一下 回复此楼
嬉皮之下尽是忧伤
3楼2016-02-24 18:04:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

sunlk

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-02-24 22:14:19
同源性是一个定性的概念，我觉得你可以选择跟你序列一致性比较高的基因，即第一个。
赞一下 回复此楼
很给力
2楼2016-02-24 14:13:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunlk

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by baierlug at 2016-02-24 18:04:13
是的两个蛋白要么是同源的，要么不是同源蛋白。基本确定第一个是，问题是我不知道第二个第三个等等是不是也是同源蛋白？怎么确定的...

按理说都是具有同源性。我们常说的两个蛋白是同源性蛋白是指一个基因在不同物种当中序列具有序列的一致性，在比较这不同物种的同一个基因功能的时候，我们会提及他们是同源性蛋白，这个是常用的。但是两个不同蛋白如果序列一致性超过10%或者50%（具体多少好像没有文章界定你可以查一下）都是具有同源性的。
赞一下 回复此楼
很给力
4楼2016-02-25 08:33:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baierlug

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sunlk at 2016-02-25 08:33:25
按理说都是具有同源性。我们常说的两个蛋白是同源性蛋白是指一个基因在不同物种当中序列具有序列的一致性，在比较这不同物种的同一个基因功能的时候，我们会提及他们是同源性蛋白，这个是常用的。但是两个不同蛋白 ...

所以您的意思是图片里的除了最后一个，都可能是A的同源蛋白？
赞一下(1人) 回复此楼
嬉皮之下尽是忧伤
5楼2016-02-25 08:57:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工328分调剂 +3 。，。，。，。i 2026-03-23 3/150 2026-03-24 10:34 by Pegasus0429
[考研] 求调剂 +4 研研，接电话 2026-03-24 5/250 2026-03-24 10:17 by 研研，接电话
[考研] 284求调剂 +10 Zhao anqi 2026-03-22 10/500 2026-03-24 00:08 by Equinoxhua
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +7 vv迷 2026-03-22 7/350 2026-03-23 23:44 by Txy@872106
[考研] 299求调剂 +5 某某某某位 2026-03-21 5/250 2026-03-23 23:36 by 热情沙漠
[考研] 一志愿中国石油大学（华东） 本科齐鲁工业大学 +4 石能伟 2026-03-17 4/200 2026-03-23 17:51 by 17862566385
[考研] 350求调剂 +6 weudhdk 2026-03-19 6/300 2026-03-23 15:47 by tangyuan0840221
[考研] 招08考数学 +6 laoshidan 2026-03-20 14/700 2026-03-23 14:37 by 15614359529
[考研] 298求调剂 +8 上岸6666@ 2026-03-20 8/400 2026-03-23 11:02 by laoshidan
[考研] 求调剂一志愿海大，0703化学学硕304分，有大创项目，四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
[考研] 287求调剂 +8 晨昏线与星海 2026-03-19 9/450 2026-03-22 17:01 by i_cooler
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[考研] 302求调剂 +12 呼呼呼。。。。 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:29 by ColorlessPI
[考研] 268求调剂 +9 简单点0 2026-03-17 9/450 2026-03-21 15:37 by lature00
[考研] 307求调剂 +3 wyyyqx 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:20 by JourneyLucky
[考研] 材料工程（专）一志愿985 初试335求调剂 +3 hiloiy 2026-03-17 4/200 2026-03-21 03:04 by JourneyLucky
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +9 何润采123 2026-03-18 11/550 2026-03-20 23:19 by JourneyLucky
[考研] 招收调剂硕士 +4 lidianxing 2026-03-19 12/600 2026-03-20 12:25 by lidianxing
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭