应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何确定一个蛋白在目标菌株中的同源蛋白？
61/1返回列表
查看: 2593  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

baierlug

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何确定一个蛋白在目标菌株中的同源蛋白？ 已有1人参与

已知E.coli的一个蛋白A，我想找到在我的菌里面的同源蛋白，请问如何确定哪个是其同源蛋白？
我把A的氨基酸序列进行blastp比对，目标菌株选定我的菌后，得到的结果如图所示，有很多个蛋白，请问哪个才是A的同源蛋白？如何确定的？谢谢！！

如何确定一个蛋白在目标菌株中的同源蛋白？
FireShot Capture 4 - NCBI Blast_Protein Sequence (490 let_ - http___blast.ncbi.nlm.nih.gov_Blast.cgi.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
嬉皮之下尽是忧伤
1楼 2016-02-24 12:36:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunlk

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-02-24 22:14:19
同源性是一个定性的概念，我觉得你可以选择跟你序列一致性比较高的基因，即第一个。
赞一下 回复此楼
很给力
2楼2016-02-24 14:13:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baierlug

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sunlk at 2016-02-24 14:13:46
同源性是一个定性的概念，我觉得你可以选择跟你序列一致性比较高的基因，即第一个。

是的两个蛋白要么是同源的，要么不是同源蛋白。基本确定第一个是，问题是我不知道第二个第三个等等是不是也是同源蛋白？怎么确定的
赞一下 回复此楼
嬉皮之下尽是忧伤
3楼2016-02-24 18:04:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunlk

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by baierlug at 2016-02-24 18:04:13
是的两个蛋白要么是同源的，要么不是同源蛋白。基本确定第一个是，问题是我不知道第二个第三个等等是不是也是同源蛋白？怎么确定的...

按理说都是具有同源性。我们常说的两个蛋白是同源性蛋白是指一个基因在不同物种当中序列具有序列的一致性，在比较这不同物种的同一个基因功能的时候，我们会提及他们是同源性蛋白，这个是常用的。但是两个不同蛋白如果序列一致性超过10%或者50%（具体多少好像没有文章界定你可以查一下）都是具有同源性的。
赞一下 回复此楼
很给力
4楼2016-02-25 08:33:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baierlug

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sunlk at 2016-02-25 08:33:25
按理说都是具有同源性。我们常说的两个蛋白是同源性蛋白是指一个基因在不同物种当中序列具有序列的一致性，在比较这不同物种的同一个基因功能的时候，我们会提及他们是同源性蛋白，这个是常用的。但是两个不同蛋白 ...

所以您的意思是图片里的除了最后一个，都可能是A的同源蛋白？
赞一下(1人) 回复此楼
嬉皮之下尽是忧伤
5楼2016-02-25 08:57:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雕刻你的拾光

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by baierlug at 2016-02-25 08:57:46
所以您的意思是图片里的除了最后一个，都可能是A的同源蛋白？...

一般ident小于百分之三十表明序列相似性低，不能是同源蛋白了吧
赞一下 回复此楼
6楼2020-11-17 11:02:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 baierlug 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 4/200 2026-09-03 03:14 by rM1TE0WVDIIY
[博后之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 6/300 2026-09-02 23:59 by rM1TE0WVDIIY
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +14 Kittylucky 2026-08-27 15/750 2026-09-02 19:35 by liumei0601
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题，而不是去凝练问题 +7 瞬息宇宙 2026-09-01 14/700 2026-09-02 17:33 by ma0526
[基金申请] 要骂人了，新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西，结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗？ +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[基金申请] 面上函评意见出来了，像什么等级？ 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉？ +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭