应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何确定一个蛋白在目标菌株中的同源蛋白？
61/1返回列表
查看: 2427  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

baierlug

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何确定一个蛋白在目标菌株中的同源蛋白？ 已有1人参与

已知E.coli的一个蛋白A，我想找到在我的菌里面的同源蛋白，请问如何确定哪个是其同源蛋白？
我把A的氨基酸序列进行blastp比对，目标菌株选定我的菌后，得到的结果如图所示，有很多个蛋白，请问哪个才是A的同源蛋白？如何确定的？谢谢！！

如何确定一个蛋白在目标菌株中的同源蛋白？
FireShot Capture 4 - NCBI Blast_Protein Sequence (490 let_ - http___blast.ncbi.nlm.nih.gov_Blast.cgi.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
嬉皮之下尽是忧伤
1楼 2016-02-24 12:36:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunlk

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-02-24 22:14:19
同源性是一个定性的概念，我觉得你可以选择跟你序列一致性比较高的基因，即第一个。
赞一下 回复此楼
很给力
2楼2016-02-24 14:13:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baierlug

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sunlk at 2016-02-24 14:13:46
同源性是一个定性的概念，我觉得你可以选择跟你序列一致性比较高的基因，即第一个。

是的两个蛋白要么是同源的，要么不是同源蛋白。基本确定第一个是，问题是我不知道第二个第三个等等是不是也是同源蛋白？怎么确定的
赞一下 回复此楼
嬉皮之下尽是忧伤
3楼2016-02-24 18:04:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunlk

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by baierlug at 2016-02-24 18:04:13
是的两个蛋白要么是同源的，要么不是同源蛋白。基本确定第一个是，问题是我不知道第二个第三个等等是不是也是同源蛋白？怎么确定的...

按理说都是具有同源性。我们常说的两个蛋白是同源性蛋白是指一个基因在不同物种当中序列具有序列的一致性，在比较这不同物种的同一个基因功能的时候，我们会提及他们是同源性蛋白，这个是常用的。但是两个不同蛋白如果序列一致性超过10%或者50%（具体多少好像没有文章界定你可以查一下）都是具有同源性的。
赞一下 回复此楼
很给力
4楼2016-02-25 08:33:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baierlug

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sunlk at 2016-02-25 08:33:25
按理说都是具有同源性。我们常说的两个蛋白是同源性蛋白是指一个基因在不同物种当中序列具有序列的一致性，在比较这不同物种的同一个基因功能的时候，我们会提及他们是同源性蛋白，这个是常用的。但是两个不同蛋白 ...

所以您的意思是图片里的除了最后一个，都可能是A的同源蛋白？
赞一下(1人) 回复此楼
嬉皮之下尽是忧伤
5楼2016-02-25 08:57:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雕刻你的拾光

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by baierlug at 2016-02-25 08:57:46
所以您的意思是图片里的除了最后一个，都可能是A的同源蛋白？...

一般ident小于百分之三十表明序列相似性低，不能是同源蛋白了吧
赞一下 回复此楼
6楼2020-11-17 11:02:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 baierlug 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +3 Promise-jyl 2026-03-23 3/150 2026-03-23 13:43 by wangkm
[考研] 306求调剂 +9 chuanzhu川烛 2026-03-18 9/450 2026-03-23 13:17 by luoyongfeng
[考研] 考研化学308分求调剂 +5 你好明天你好 2026-03-23 6/300 2026-03-23 11:02 by 素颜倾城1988
[考研] 276求调剂 +3 YNRYG 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:31 by 醉在风里
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +5 vv迷 2026-03-22 5/250 2026-03-23 07:36 by Iveryant
[考研] 289材料与化工（085600）B区求调剂 +3 这么名字咋样 2026-03-22 4/200 2026-03-22 17:56 by 云民大李老师
[考博] 招收博士1-2人 +3 QGZDSYS 2026-03-18 4/200 2026-03-22 10:25 by QGZDSYS
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[考研] 313求调剂 +4 肆叁贰壹22 2026-03-19 4/200 2026-03-21 17:33 by ColorlessPI
[考研] 279分求调剂 一志愿211 +14 chaojifeixia 2026-03-19 15/750 2026-03-21 13:24 by zhukairuo
[考研] 316求调剂 +6 梁茜雯 2026-03-19 6/300 2026-03-21 06:32 by Ecowxq666！
[考研] 070300化学319求调剂 +7 锦鲤0909 2026-03-17 7/350 2026-03-21 03:46 by JourneyLucky
[考研] 初始318分求调剂（有工作经验） +3 1911236844 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中科技大学，080502，354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
[考研] 0856调剂，是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 085600材料与化工调剂 324分 +10 llllkkkhh 2026-03-18 12/600 2026-03-19 14:33 by llllkkkhh
[考研] 材料，纺织，生物（0856、0710），化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭