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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】用MS如何设定某个原子的所带的电荷
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冻冻2007

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】用MS如何设定某个原子的所带的电荷

用dmol软件，如果需要计算一个带电的体系，这个体系是由两部分组成。初始结构我设定其中一个小体系带电，一个小体系不带电。然后使两个小体系接触，优化结构，分析整个体系的带电情况。想问一下大家，如何设定体系中某个原子的带电情况。

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-25 at 19:24 ]
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1楼 2008-10-08 09:05:54
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acridine

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhenben at 2008-10-8 09:16:
选中你要带电的原子，properties一栏中filter选择Atom第一项就是charge，双击就可以改了，试试吧

这个方法在dmol中好用吗？
dmol模块下不能设置原子带电吧，只能设置体系总电荷
想一下DFT的原理，对体系增加一个电荷很容易办到，占据数加1就可以了。而如果对某个原子增加电荷，需要在DFT自洽计算的同时，约束一个电子局域在这个原子周围，这个就不容易了，Dmol的理论介绍中好像也没有提到这个。
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6楼2008-10-08 19:53:11
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zhenben

铜虫 (初入文坛)
★
灯塔守望者(金币+1,VIP+0):谢谢支持小木虫
选中你要带电的原子，properties一栏中filter选择Atom第一项就是charge，双击就可以改了，试试吧
赞一下(10人) 回复此楼
2楼2008-10-08 09:16:31
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛
★
gromacs(金币+1,VIP+0):谢谢指点
还有个比较好的做法：就是选中该原子之后，选择modify菜单下electronic configuration也可以修改该原子的电荷，并且你修改后的原子的电子结构会直接给出
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3楼2008-10-08 10:57:50
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dezhi603

木虫 (小有名气)
你可以进行下电荷分析，然后选中你要该原子，在label中选charge就行了。
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4楼2008-10-08 11:18:52
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