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【求助】用MS如何设定某个原子的所带的电荷
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用dmol软件，如果需要计算一个带电的体系，这个体系是由两部分组成。初始结构我设定其中一个小体系带电，一个小体系不带电。然后使两个小体系接触，优化结构，分析整个体系的带电情况。想问一下大家，如何设定体系中某个原子的带电情况。 [ Last edited by freshgirl on 2009-6-25 at 19:24 ] |
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dezhi603
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- 专业: 药物化学
4楼2008-10-08 11:18:52
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谢谢大家的回复，我按照以上说的方法改变了初始结构中某些原子的电荷，然后在calculation的对话框中将charge选项改成了所有电荷的总值，然后进行单点能计算发现：只要是单胞中总的电荷相同，即calculation对话框中charge选项中的值相同，不论初始结构中选择的是哪一个部分带电，最后计算得到的每个原子的Hirshfeld charge都是相同。而这应该是不对的。比如一个带电的离子吸附到一个不带电的表面和一个不带电的原子吸附到一个带电的表面，最后的结果应该是不同的。请问大家是怎么看的？有没有遇到过这个问题？ [ Last edited by 冻冻2007 on 2008-10-9 at 08:17 ] |
5楼2008-10-08 15:05:20