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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】用MS如何设定某个原子的所带的电荷
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冻冻2007

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】用MS如何设定某个原子的所带的电荷

用dmol软件，如果需要计算一个带电的体系，这个体系是由两部分组成。初始结构我设定其中一个小体系带电，一个小体系不带电。然后使两个小体系接触，优化结构，分析整个体系的带电情况。想问一下大家，如何设定体系中某个原子的带电情况。

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-25 at 19:24 ]
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1楼 2008-10-08 09:05:54
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冻冻2007

铜虫 (小有名气)
谢谢大家的回复，我按照以上说的方法改变了初始结构中某些原子的电荷，然后在calculation的对话框中将charge选项改成了所有电荷的总值，然后进行单点能计算发现：只要是单胞中总的电荷相同，即calculation对话框中charge选项中的值相同，不论初始结构中选择的是哪一个部分带电，最后计算得到的每个原子的Hirshfeld charge都是相同。而这应该是不对的。比如一个带电的离子吸附到一个不带电的表面和一个不带电的原子吸附到一个带电的表面，最后的结果应该是不同的。请问大家是怎么看的？有没有遇到过这个问题？

[ Last edited by 冻冻2007 on 2008-10-9 at 08:17 ]
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5楼2008-10-08 15:05:20
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zhenben

铜虫 (初入文坛)
★
灯塔守望者(金币+1,VIP+0):谢谢支持小木虫
选中你要带电的原子，properties一栏中filter选择Atom第一项就是charge，双击就可以改了，试试吧
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2楼2008-10-08 09:16:31
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛
★
gromacs(金币+1,VIP+0):谢谢指点
还有个比较好的做法：就是选中该原子之后，选择modify菜单下electronic configuration也可以修改该原子的电荷，并且你修改后的原子的电子结构会直接给出
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3楼2008-10-08 10:57:50
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dezhi603

木虫 (小有名气)
你可以进行下电荷分析，然后选中你要该原子，在label中选charge就行了。
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4楼2008-10-08 11:18:52
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