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甲斐之虎

银虫 (正式写手)

[求助] Silicane静态计算之后利用Bader分析发现两个Si的电荷数居然不等,还相差很大…… 已有1人参与

前几天计算Silicane(单层Silicene两边用H饱和的结构,Silicene是一种二维材料),發現一個問題……
结构优化,静态计算之後,进行Bader分析,结果相当出人意料,两个Si的电荷数居然不等!
要知道,这两个Si是完全等价的……
分析结果如下:
    #         X           Y           Z        CHARGE     MIN DIST    ATOMIC VOL
--------------------------------------------------------------------------------
    1      2.2286      0.0000      9.5609      3.5469      0.7023     20.9265
    2      4.4571      0.0000     10.2849      3.2780      0.7023     19.4710
    3      2.2286      0.0000      8.0619      1.5876      0.7280    107.8755
    4      4.4571      0.0000     11.7838      1.5876      0.7280    107.8053
--------------------------------------------------------------------------------
    VACUUM CHARGE:               0.0000
    VACUUM VOLUME:               0.0000
    NUMBER OF ELECTRONS:        10.0000
一个Si是3.5469,另一个是3.2780,这两个数值相差的还挺大

开始以为是精度不够,但是加大K点到45X45X1,还是不等……

尝试加大NGX, NGY, NGZ
还是不行

将原胞扩展成2X2超胞之后,也还是不行,Si原子之间的电子数就是不等……

不知道有没有前辈遇到过这个问题,还请各位多多赐教……
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别人笑我太疯颠,我笑他人看不穿。不见五陵豪杰墓,无花无酒锄作田。
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甲斐之虎

银虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by lfhuang at 2016-02-05 00:47:59
应该很多人已经在VASP上实现了玛丽肯,但我不知道是否有人公开他们的代码,楼主可以搜索一下看看。
巴德也是UT Ausdin那帮人做的,只是他们公开了他们的代码而已。个人浅见,对于量子化学邻域,最常用的还是原子轨 ...

大神,你的文章确实很不错,不过小生还是看不太懂,也罢,以后慢慢消化吧,多谢您的指教
别人笑我太疯颠,我笑他人看不穿。不见五陵豪杰墓,无花无酒锄作田。
8楼2016-02-06 21:07:05
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jjqaz

铜虫 (小有名气)

楼主能分享下怎么建立硅烯结构模型么?
2楼2016-01-29 13:08:41
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lfhuang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
甲斐之虎: 金币+100, ★★★★★最佳答案 2016-02-03 11:27:41
这也正常,因为Bader以电荷密度极小处做为原子边界分割点,这种方法其实是不适合共价体系。Si-Si键当中有较大电荷密度,如以下文章图1(b):
http://journals.aps.org/prb/abstract/10.1103/PhysRevB.91.205433

所以Bader方法在分割原子边界时,可定会避开Si-Si中间电荷极大点,而选择靠近其中一个原子的某个地方做为边界,所以会导致两个原子不均等了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

先进使役材料计算(https://aidme.nimte.ac.cn)
3楼2016-01-30 06:34:00
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甲斐之虎

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lfhuang at 2016-01-30 06:34:00
这也正常,因为Bader以电荷密度极小处做为原子边界分割点,这种方法其实是不适合共价体系。Si-Si键当中有较大电荷密度,如以下文章图1(b):
http://journals.aps.org/prb/abstract/10.1103/PhysRevB.91.205433

...

这几天回家坐车中……
多谢黄良锋大神指教!
不知道这个问题有什么解决之道吗?貌似vasp不能用玛丽肯,只能用巴德?
别人笑我太疯颠,我笑他人看不穿。不见五陵豪杰墓,无花无酒锄作田。
4楼2016-02-03 11:35:59
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