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sunny_sky681

木虫 (小有名气)

浴火重生的凤凰

[交流] [求助]过渡态寻找和优化QST2输入的问题

请教关于过渡态OPT输入的问题,其中QST2方法是要输入反应物和产物两个坐标的,格式如下:
反应 SiH4-->TS-->SiH2+H2

# RHF/6-31G(d) OPT=QST2 Freq Test

Untitled

0,1
reactance(SiH4)

Untitled

0,1
product(SiH2+H2)

那么对于反应A+B--->C+D这样的反应呢,该如何输入呢?(假设A和C是主要的反应物和产物)

----------------分割线-----------------------------

我在网上查到一些资料,请教解读一下咯,其中的H2放在哪里了呢?
对于反应 SiH4-->TS-->SiH2+H2
这是一个A--->B+C 的反应

%chk=qst2
#hf/3-21g* opt=(QST2,noeigen,redundant) freq Test

SiH4 -->SiH2+H2   Reactants

0  1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.48
A1=125.2
A2=109.5

SiH4-->SiH2+H2  products

2  3
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.69
A1=82.0
A2=28.0

以上语句,前后的原子数是一样的!但是H2不是已经分出去了嘛?为什么咯
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做一个善良的人
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sunny_sky681

木虫 (小有名气)

浴火重生的凤凰

引用回帖:
Originally posted by gaochao85 at 2008-10-6 17:19:
其实 就是把SiH2与H2放在一个适当的距离, 就是molecule-molecule complex
然后优化

MM法优化?我不清楚这个适当的距离是怎么摆啊,就是随便画的吗?而且虽然画在一起,但是分开的话,原子标号也调不来...抱歉,我不会手动输入坐标,都是用hyperchem的...
做一个善良的人
5楼2008-10-06 20:26:59
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gaochao85

铜虫 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
QST2要求过渡态两边的两个中间体,这两个中间体一般是较稳定的复合物,你后面应该是一个产物复合物
2楼2008-10-06 16:40:04
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sunny_sky681

木虫 (小有名气)

浴火重生的凤凰

引用回帖:
Originally posted by gaochao85 at 2008-10-6 16:40:
QST2要求过渡态两边的两个中间体,这两个中间体一般是较稳定的复合物,你后面应该是一个产物复合物

何谓产物复合物?不知道怎么把SiH2和H2合并到一起咯...就是这个不懂啦,我碰到的是A+B+C--->E+F形式的反应,汗~
做一个善良的人
3楼2008-10-06 16:42:23
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gaochao85

铜虫 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
其实 就是把SiH2与H2放在一个适当的距离, 就是molecule-molecule complex
然后优化
4楼2008-10-06 17:19:03
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