24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 807  |  回复: 8
当前主题已经存档。

sunny_sky681

木虫 (小有名气)

浴火重生的凤凰

[交流] [求助]过渡态寻找和优化QST2输入的问题

请教关于过渡态OPT输入的问题,其中QST2方法是要输入反应物和产物两个坐标的,格式如下:
反应 SiH4-->TS-->SiH2+H2

# RHF/6-31G(d) OPT=QST2 Freq Test

Untitled

0,1
reactance(SiH4)

Untitled

0,1
product(SiH2+H2)

那么对于反应A+B--->C+D这样的反应呢,该如何输入呢?(假设A和C是主要的反应物和产物)

----------------分割线-----------------------------

我在网上查到一些资料,请教解读一下咯,其中的H2放在哪里了呢?
对于反应 SiH4-->TS-->SiH2+H2
这是一个A--->B+C 的反应

%chk=qst2
#hf/3-21g* opt=(QST2,noeigen,redundant) freq Test

SiH4 -->SiH2+H2   Reactants

0  1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.48
A1=125.2
A2=109.5

SiH4-->SiH2+H2  products

2  3
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.69
A1=82.0
A2=28.0

以上语句,前后的原子数是一样的!但是H2不是已经分出去了嘛?为什么咯
回复此楼
做一个善良的人
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaochao85

铜虫 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
QST2要求过渡态两边的两个中间体,这两个中间体一般是较稳定的复合物,你后面应该是一个产物复合物
2楼2008-10-06 16:40:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunny_sky681

木虫 (小有名气)

浴火重生的凤凰

引用回帖:
Originally posted by gaochao85 at 2008-10-6 16:40:
QST2要求过渡态两边的两个中间体,这两个中间体一般是较稳定的复合物,你后面应该是一个产物复合物

何谓产物复合物?不知道怎么把SiH2和H2合并到一起咯...就是这个不懂啦,我碰到的是A+B+C--->E+F形式的反应,汗~
做一个善良的人
3楼2008-10-06 16:42:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaochao85

铜虫 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
其实 就是把SiH2与H2放在一个适当的距离, 就是molecule-molecule complex
然后优化
4楼2008-10-06 17:19:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunny_sky681

木虫 (小有名气)

浴火重生的凤凰

引用回帖:
Originally posted by gaochao85 at 2008-10-6 17:19:
其实 就是把SiH2与H2放在一个适当的距离, 就是molecule-molecule complex
然后优化

MM法优化?我不清楚这个适当的距离是怎么摆啊,就是随便画的吗?而且虽然画在一起,但是分开的话,原子标号也调不来...抱歉,我不会手动输入坐标,都是用hyperchem的...
做一个善良的人
5楼2008-10-06 20:26:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

農貓

铁杆木虫 (小有名气)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
同意三樓的說法
我也是這麼做
曾經想要使用QST2進行優化
然而到目前為止?奈闯晒^
曾試過
1. 手動調整原子標號
2. 自動調整原子標號
6楼2008-10-07 00:03:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mscic

金虫 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
直接用TS优化吧,根据反应物,产物猜测一个TS的初始结构就行了.
QST2需要三个结构,TS的结构,TS两边的IM结构(就是上面说的COMPLEX,所谓复合物就是键要断未断的那个结构,呵呵).
7楼2008-10-07 09:12:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunny_sky681

木虫 (小有名气)

浴火重生的凤凰


spur(金币+1,VIP+0):3Q!欢迎常来!
引用回帖:
Originally posted by mscic at 2008-10-7 09:12:
直接用TS优化吧,根据反应物,产物猜测一个TS的初始结构就行了.
QST2需要三个结构,TS的结构,TS两边的IM结构(就是上面说的COMPLEX,所谓复合物就是键要断未断的那个结构,呵呵).

恩,键要断未断就是虚键吧,只是反应式比较复杂的时候,无法把所有的都汇集到一起啊,这个可能我要再想想咯。另外,用TS得到过渡态,还是需要用QST2来优化过渡态才比较好吧...
做一个善良的人
8楼2008-10-07 11:34:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

農貓

铁杆木虫 (小有名气)

★ ★
spur(金币+2,VIP+0):3Q!欢迎常来!
???????:
Originally posted by mscic at 2008-10-7 09:12:
?????TS?????,????????,?????????TS????????????.
QST2?????????,TS???,TS?????IM??(???????????COMPLEX,??ν?????????????δ????????,???).

??????TS????
???^?P?QST2?cQST3
QST3????????Y??
QST2?????????Y??
??????????^?@??N????
???^QST3????o??????^?ɑB?Y??
?@??????TS????]?в??

???h??????????TS
9楼2008-10-07 22:18:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sunny_sky681 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿华中农业071010,320求调剂 +17 困困困困坤坤 2026-04-14 19/950 2026-04-17 20:08 by 关一盏灯cd
[考研] 320求调剂 +4 深郊akm 2026-04-17 4/200 2026-04-17 17:32 by 一切OK
[考研] 335求调剂 +20 想上岸呀!! 2026-04-12 23/1150 2026-04-17 10:50 by cuisz
[考研] 279求调剂 +13 张番茄不炒蛋 2026-04-11 13/650 2026-04-17 10:38 by cuisz
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 5/250 2026-04-17 10:02 by bobvan
[考研] 恳请有学校收留 +8 柯淮然 2026-04-12 8/400 2026-04-17 09:34 by 猪会飞
[考研] 297,工科调剂? +4 河南农业大学-能 2026-04-14 4/200 2026-04-16 22:52 by wulijun2012
[考研] 291求调剂 +9 关忆北. 2026-04-14 9/450 2026-04-16 22:49 by cfdbai
[考研] 22专硕求调剂 +10 haoyun上岸 2026-04-11 12/600 2026-04-16 22:21 by 猪会飞
[考研] 327求调剂 +26 Xxjc1107. 2026-04-13 29/1450 2026-04-16 10:52 by Espannnnnol
[考研] 290调剂生物0860 +38 哇哈哈,。 2026-04-11 44/2200 2026-04-16 09:52 by cuisz
[考研] 一志愿A区211,22408 321求调剂 +6 随心所欲☆ 2026-04-15 7/350 2026-04-15 21:45 by lbsjt
[考研] 366求调剂 +11 不知名的小卅 2026-04-11 11/550 2026-04-14 15:50 by zs92450
[考研] 调剂 +12 月@163.com 2026-04-11 12/600 2026-04-14 15:37 by zs92450
[考研] 考研求调剂 +12 子木呐 2026-04-12 13/650 2026-04-14 01:19 by 王珺璞
[考研] 2026硕士调剂_能动_河南农业大学 +4 河南农业大学-能 2026-04-12 4/200 2026-04-13 22:01 by bljnqdcc
[考研] 302求调剂 +10 易!? 2026-04-13 10/500 2026-04-13 19:04 by lbsjt
[考研] 290求调剂 +18 柯淮然 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 12:56 by cyh—315
[考研] 一志愿085802 323分求调剂 +13 drizzle_9 2026-04-12 14/700 2026-04-13 10:26 by Faiz5552
[考研] +10 李多米lee. 2026-04-12 11/550 2026-04-12 22:58 by yuyin1233
信息提示
请填处理意见