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xiemeng101新虫 (小有名气)
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wfn画nbo轨道 求助
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我想用wfn画nbo轨道。是参照使Sobereva写的《用Multiwfn绘制NBO及相关轨道 》里提到的方法，文中提到：“注意fch文件中的轨道编号和Gaussian的NBO 3.1模块(L607)显示的轨道编号不全一致，在存入fch文件时会进行重排，NBO模块输出信息末尾的Sorting of NBOs和Reordering of NBOs for storage部分显示的序号是重排前后的对应关系“。 我想画的是 87. LP ( 1) N 18 /510. BD*( 1)Se 11 -Br 12 E(2) =26.44 即 第 87号轨道 N的孤对电子与第 510 号轨道 Se-Br反键之间的轨道重叠作用。 检查了轨道重排前后的变化，发现没有这两个都没有发生重排。但是，在用wfn画这两轨道时，发现好像都不是对应的轨道，如下图表示：87号对应的却是 吡啶环上C13-C14的轨道，510号轨道却是苯环上的轨道。而且，两者之间没有轨道重叠的现象。 不知道是怎么回事？急求答案。  87号轨道  87和510轨道都存在的图  重排前  重排后  510号轨道  重排前后的比较 |
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4楼2016-01-26 19:34:46
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已找到原因：在《使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道 (2)》中，Sobereva 写到： 注意fch文件中的轨道编号和Gaussian的NBO 3.1模块(L607)显示的轨道编号通常不一致。比如在NBO输出信息最后显示 Reordering of NBOs for storage: 7 8 3 1 2 4 6 5 9 38 ... 那么就是说明chk/fch文件里的1号轨道对应于NBO7，2号轨道对应NBO8，3号轨道对应NBO3，4号轨道对应NBO1...无论你用gview看这个chk文件，还是用Multiwfn看相应的fch文件，当你选比如第2号轨道，显示的都是NBO8。 是轨道的对应关系弄错了。希望这个问题对大家也有帮助。  |
2楼2016-01-26 14:49:50
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5楼2016-01-27 11:14:39