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xiemeng101

新虫 (小有名气)

[求助] wfn画nbo轨道 求助

我想用wfn画nbo轨道。是参照使Sobereva写的《用Multiwfn绘制NBO及相关轨道  》里提到的方法,文中提到:“注意fch文件中的轨道编号和Gaussian的NBO 3.1模块(L607)显示的轨道编号不全一致,在存入fch文件时会进行重排,NBO模块输出信息末尾的Sorting of NBOs和Reordering of NBOs for storage部分显示的序号是重排前后的对应关系“。


我想画的是   87. LP (   1) N  18                /510. BD*(   1)Se  11 -Br  12          E(2) =26.44     即 第 87号轨道  N的孤对电子与第 510 号轨道 Se-Br反键之间的轨道重叠作用。

检查了轨道重排前后的变化,发现没有这两个都没有发生重排。但是,在用wfn画这两轨道时,发现好像都不是对应的轨道,如下图表示:87号对应的却是
吡啶环上C13-C14的轨道,510号轨道却是苯环上的轨道。而且,两者之间没有轨道重叠的现象。


不知道是怎么回事?急求答案。

wfn画nbo轨道  求助
87号轨道


wfn画nbo轨道  求助-1
87和510轨道都存在的图


wfn画nbo轨道  求助-2
重排前


wfn画nbo轨道  求助-3
重排后


wfn画nbo轨道  求助-4
510号轨道


wfn画nbo轨道  求助-5
重排前后的比较
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小范范1989

木虫 (著名写手)

我觉着,你应该看的是78 和90.
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
3楼2016-01-26 19:33:31
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xiemeng101

新虫 (小有名气)

已找到原因:在《使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道 (2)》中,Sobereva 写到:

注意fch文件中的轨道编号和Gaussian的NBO 3.1模块(L607)显示的轨道编号通常不一致。比如在NBO输出信息最后显示 Reordering of NBOs for storage: 7 8 3 1 2 4 6 5 9 38 ... 那么就是说明chk/fch文件里的1号轨道对应于NBO7,2号轨道对应NBO8,3号轨道对应NBO3,4号轨道对应NBO1...无论你用gview看这个chk文件,还是用Multiwfn看相应的fch文件,当你选比如第2号轨道,显示的都是NBO8。  

是轨道的对应关系弄错了。希望这个问题对大家也有帮助。
2楼2016-01-26 14:49:50
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小范范1989

木虫 (著名写手)

不好意思,我看你已经解决了,我本来想早点恢复。但是有事,所以就留在你的这个窗口了,回来之后回复你,然后看到你已经解决了。
不知道我的理解对不对。
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
4楼2016-01-26 19:34:46
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xiemeng101

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 小范范1989 at 2016-01-26 19:33:31
我觉着,你应该看的是78 和90.

恩,是78和90.
5楼2016-01-27 11:14:39
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