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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 怎么判断一个蛋白是否为水溶性蛋白？
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我爱开组会

金虫 (小有名气)

[求助] 怎么判断一个蛋白是否为水溶性蛋白？ 已有1人参与

怎么判断一个蛋白是否为水溶性蛋白？我有它的氨基酸序列，能不能从序列上判断其是否可以水溶，还是脂溶？有没有什么软件或者网站能帮助找出？
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1楼 2016-01-23 17:41:48
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新虫 (小有名气)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-23 22:42:30
序列嘛？有网站啊，对着查好像可以，那个不必担心三级结构，因为网站的数据也是有实验来的，别人先验证蛋白质是否为水溶，然后再测序的，所以可以相信

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6楼2016-01-23 18:36:38
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bright8

铁杆木虫 (著名写手)
有网站的，有个脂溶系数滴！

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2楼2016-01-23 17:59:23
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我爱开组会

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by bright8 at 2016-01-23 17:59:23
有网站的，有个脂溶系数滴！

ProtParam 吗     
Aliphatic index: 92.52
Grand average of hydropathicity (GRAVY): -0.054

这个说明是脂溶还是水溶

但是这个网站说的是按一级结构算的，如果一个蛋白按他的自然态三级结构来讲 这个一级结构的结果准吗
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3楼2016-01-23 18:08:25
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新虫 (小有名气)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-23 22:42:07
依我看，实际的做法可以把它加入水中，如果没有明显不溶物，再看它的水溶液是否具有丁达尔效应，如果没有，是不是可以判定为水溶啊，

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4楼2016-01-23 18:13:50
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