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金虫 (小有名气)

[求助] 怎么判断一个蛋白是否为水溶性蛋白? 已有1人参与

怎么判断一个蛋白是否为水溶性蛋白?我有它的氨基酸序列,能不能从序列上判断其是否可以水溶,还是脂溶?有没有什么软件或者网站能帮助找出?
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bright8

铁杆木虫 (著名写手)

2楼2016-01-23 17:59:23
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我爱开组会

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bright8 at 2016-01-23 17:59:23
有网站的,有个脂溶系数滴!

ProtParam 吗     
Aliphatic index: 92.52
Grand average of hydropathicity (GRAVY): -0.054

这个说明是脂溶还是水溶

但是这个网站说的是按一级结构算的,如果一个蛋白按他的自然态三级结构来讲 这个一级结构的结果准吗
3楼2016-01-23 18:08:25
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link159357

新虫 (小有名气)

★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-23 22:42:07
依我看,实际的做法可以把它加入水中,如果没有明显不溶物,再看它的水溶液是否具有丁达尔效应,如果没有,是不是可以判定为水溶啊,

发自小木虫Android客户端
4楼2016-01-23 18:13:50
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我爱开组会

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by link159357 at 2016-01-23 18:13:50
依我看,实际的做法可以把它加入水中,如果没有明显不溶物,再看它的水溶液是否具有丁达尔效应,如果没有,是不是可以判定为水溶啊,

我没有实际的蛋白,只有他的氨基酸序列。  有没有氨基酸序列理论上的方法?
5楼2016-01-23 18:17:35
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link159357

新虫 (小有名气)

★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-23 22:42:30
序列嘛?有网站啊,对着查好像可以,那个不必担心三级结构,因为网站的数据也是有实验来的,别人先验证蛋白质是否为水溶,然后再测序的,所以可以相信

发自小木虫Android客户端
6楼2016-01-23 18:36:38
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lizg8688

新虫 (初入文坛)

7楼2016-01-23 22:28:46
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zhang001zh

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
我爱开组会: 金币+20, ★★★很有帮助, 根据我的检索,以及各位网友的帮助,知道如何进行辨别水溶或脂溶性蛋白了。 2016-01-25 23:36:11
你这个蛋白应该是疏水性较高的蛋白
8楼2016-01-25 17:24:22
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金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by zhang001zh at 2016-01-25 17:24:22
你这个蛋白应该是疏水性较高的蛋白

谢谢你的回复。 差不多在网友帮助和自己查阅检索下搞定了。

发自小木虫Android客户端
9楼2016-01-25 23:33:37
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