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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp脚本问题
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小雨熊

木虫 (正式写手)

[求助] vasp脚本问题 已有1人参与

pbs提交任务的脚本 在单独运行vasp任务时可以用，但是在pbs脚本中调用force脚本，任务就不动了，是哪里搞错了？

vasp脚本问题
未命名.JPG
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1楼 2016-01-23 17:03:23
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wobure

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小雨熊: 金币+5, ★★★很有帮助, 试过直接加到pbs脚本中，也是卡住不动 2016-01-24 19:33:28
建议把里边的脚本内容直接放到pbs脚本中试试
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5楼2016-01-23 19:54:01
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wobure

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
能提交上去么？报的什么错误，force脚本是shell脚本？是force脚本没算，还是vasp没算。。
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2楼2016-01-23 17:29:23
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小雨熊

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wobure at 2016-01-23 17:29:23
能提交上去么？报的什么错误，force脚本是shell脚本？是force脚本没算，还是vasp没算。。

嗯 force是shell脚本，任务能提交上去，但是force没算
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3楼2016-01-23 17:55:10
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小雨熊

木虫 (正式写手)
#!/bin/sh

for a in 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30
do
cp POSCAR-0$a POSCAR
mpiexec -np 20 vasp >> log
cp vasprun.xml vasprun.xml-0$a
done

这个是force文件

正常执行的结果应该是在log文件中显示


running on    2 nodes
distr:  one band on    2 nodes,    1 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found :  2 types and   16 ions
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...(           1 )
reading WAVECAR
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
RMM:   1     0.709851747703E+03    0.70985E+03   -0.27547E+04  1640   0.141E+03


但是现在log文件显示


POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected
FFT: planning ...
WAVECAR not read

然后卡住不动
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4楼2016-01-23 18:26:19
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