24小时热门版块排行榜    

查看: 1690  |  回复: 19
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

小雨熊

木虫 (正式写手)

[求助] vasp脚本问题 已有1人参与

pbs提交任务的脚本 在单独运行vasp任务时可以用,但是在pbs脚本中调用force脚本,任务就不动了,是哪里搞错了?

vasp脚本问题
未命名.JPG
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小雨熊

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wobure at 2016-01-23 17:29:23
能提交上去么?报的什么错误,force脚本是shell脚本?是force脚本没算,还是vasp没算。。

嗯 force是shell脚本,任务能提交上去,但是force没算
3楼2016-01-23 17:55:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答

wobure

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
能提交上去么?报的什么错误,force脚本是shell脚本?是force脚本没算,还是vasp没算。。
2楼2016-01-23 17:29:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小雨熊

木虫 (正式写手)

#!/bin/sh

for a in 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30
do
cp POSCAR-0$a POSCAR
mpiexec -np 20 vasp >> log
cp vasprun.xml vasprun.xml-0$a
done

这个是force文件

正常执行的结果应该是在log文件中显示


running on    2 nodes
distr:  one band on    2 nodes,    1 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found :  2 types and   16 ions
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...(           1 )
reading WAVECAR
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
RMM:   1     0.709851747703E+03    0.70985E+03   -0.27547E+04  1640   0.141E+03


但是现在log文件显示


POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected
FFT: planning ...
WAVECAR not read

然后卡住不动
4楼2016-01-23 18:26:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wobure

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小雨熊: 金币+5, ★★★很有帮助, 试过直接加到pbs脚本中,也是卡住不动 2016-01-24 19:33:28
建议把里边的脚本内容直接放到pbs脚本中试试
5楼2016-01-23 19:54:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考! +3 lemonzzn 2026-03-17 3/150 2026-03-19 23:58 by 23Postgrad
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +18 rare12345 2026-03-18 18/900 2026-03-19 22:36 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +3 葵梓卫队 2026-03-18 5/250 2026-03-19 19:35 by 给你你注意休息
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +9 一鸭鸭哟 2026-03-14 11/550 2026-03-19 17:22 by !本暗一次!
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 6/300 2026-03-19 17:18 by fei626-918
[考研] 【考研调剂】化学专业 281分,一志愿四川大学,诚心求调剂 +5 吃吃吃才有意义 2026-03-19 5/250 2026-03-19 16:18 by 30660438
[考研] 一志愿天津大学化学工艺专业(081702)315分求调剂 +11 yangfz 2026-03-17 11/550 2026-03-19 15:06 by houyaoxu
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +5 枫桥ZL 2026-03-18 7/350 2026-03-19 14:52 by 功夫疯狂
[考研] 化学求调剂 +3 临泽境llllll 2026-03-17 4/200 2026-03-19 13:59 by houyaoxu
[考研] 085600材料与化工求调剂 +6 绪幸与子 2026-03-17 6/300 2026-03-19 13:27 by houyaoxu
[考研] 材料080500调剂求收留 +4 一颗meteor 2026-03-13 4/200 2026-03-19 10:32 by 30660438
[考研] 311求调剂 +4 冬十三 2026-03-18 4/200 2026-03-18 21:47 by 尽舜尧1
[考研] 材料专业求调剂 +5 hanamiko 2026-03-18 5/250 2026-03-18 20:19 by 星空星月
[考研] 295求调剂 +3 一志愿京区211 2026-03-18 5/250 2026-03-18 17:03 by zhaoqian0518
[考研] 265求调剂 +3 梁梁校校 2026-03-17 3/150 2026-03-18 09:12 by zhukairuo
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] 278求调剂 +3 Yy7400 2026-03-13 3/150 2026-03-17 08:24 by laoshidan
[考研] 机械专硕325,寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 招收0805(材料)调剂 +3 18595523086 2026-03-13 3/150 2026-03-14 00:33 by 123%、
信息提示
请填处理意见