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cynjau

金虫 (小有名气)

[交流] 转化10多次得不到转化子,请大家帮忙分析

最经一个多月一直在做这个实验,10次多没有获得重组子,很是郁闷.请大家帮忙分析一下:
(1)目的片段先克隆到pMD19 sample上提取质粒,用TAKARA购买的BamHI和speI双酶切12小时,回收我的目的片段300bp;
(2)重组用的质粒约5900bp,同样用TAKARA购买的BamHI和speI双酶切12小时,回收酶切产物;
(3)回收的目的片段和载体电泳后估计其浓度后,按照载体:目的片段=1:10来T4连接酶16度,连接16小时后转化;

我觉得转化和感受态没有问题啊,10多次了,感受态也用T载体检测了没有问题的!可是就是不知道为什么就是得不到重组子啊?
现在怀疑是不是没有连接上。可是载体5900bp,目的片段300bp.连接产物电泳和质粒在胶上也看不出来啊!有什么办法确定是否连接上呢?
还有就是在转化后吸取100ul涂在抗性平板上,有时出现满板的糊状,一片一片的,仔细看是些很微小微小的菌落,可是他们长48小时还是那么小,这有是怎么回事?

请大家帮忙分析啊,谢谢啊,极度郁闷中!
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silviasj

金虫 (著名写手)

建议
1、直接从质粒上pcr你的目的片段,不要从质粒上酶切,pcr完直接回收,不要切胶回收,回收之前跑1微升看看,有没有杂带,杂带太多就不能直接回收了。
2、质粒酶切完,也直接回收,不要切胶回收,不过这样肯定会有空质粒,有假阳性,需要耐心挑选。
3、载体:目的片段=1:4
4、连接之前,加入载体目的基因后65度水浴热激2分钟,后加入连接酶,连接16小时以上,转化。
5、连接产物验证可以用pcr方式检验,设计引物,该引物包含一段载体片段且包含一段你得目的基因片段,PCR,看是否有相应大小条带,可以测序,看是否连接上。

因为切胶回收会影响连接,能不切尽量不要切,热激有助于连接,不会影响DNA,再多转几次,注意不要染菌。有了转化子,尽量全部验证。
祝早日成功~
5楼2008-10-05 22:42:14
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fengyalan2

即使连接成功电泳也检测不到,量太少了,更本不在电泳检测的范围之内!
如果你用氨苄青霉素筛选,建议不要培养那么长时间。37度下氨苄青霉素过夜基本就失效了。培养时间过长,长出来的是感受态细胞并非转化子。
2楼2008-10-05 08:51:30
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cynjau

金虫 (小有名气)

我用的是庆大霉素抗性质粒的,好像大肠杆菌长的比较慢的。质粒本身在宿主菌株中就要24小时以上才能长的较大
3楼2008-10-05 09:04:24
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wordsworth3180

木虫 (正式写手)

请问 你是怎么回收的酶切产物?
4楼2008-10-05 21:13:25
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