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构建系统发育树时遇到的问题 已有2人参与
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最近对得到的18个16S rDNA序列（F1-13，C2，5，6，7，10）在blast进行比对，然后选取相似度较高的序列，并下载其fasta格式的序列。然后直接用MEGA 5.10构建系统发育树。结果却让我百思不得其解：F1、F9、F13、C5、C7并没有与其相似度高的物种聚在一起，而是单独分开（如图）。请问：这是什么原因造成的呢？是选取序列时有误吗？还是在构建系统发育树的过程中有误呢？ 希望大家帮帮忙，不胜感激   系统发育树-小木虫求助.jpg |
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3楼2016-01-18 20:10:41
2楼2016-01-18 19:47:27
沉默的独角兽
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【答案】应助回帖
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-18 22:57:45
hhzxxt: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-01-19 13:15:07
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是不是序列是反向互补的，一般会是这个原因 发自小木虫Android客户端 |
4楼2016-01-18 21:28:04
5楼2016-01-19 09:12:08
