| 查看: 2464 | 回复: 12 | ||
[求助]
构建系统发育树时遇到的问题 已有2人参与
|
|
最近对得到的18个16S rDNA序列（F1-13，C2，5，6，7，10）在blast进行比对，然后选取相似度较高的序列，并下载其fasta格式的序列。然后直接用MEGA 5.10构建系统发育树。结果却让我百思不得其解：F1、F9、F13、C5、C7并没有与其相似度高的物种聚在一起，而是单独分开（如图）。请问：这是什么原因造成的呢？是选取序列时有误吗？还是在构建系统发育树的过程中有误呢？ 希望大家帮帮忙，不胜感激   系统发育树-小木虫求助.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有246人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 构建系统发育树时，如何选择方法如邻接法，最大简约法等？
已经有1人回复
2楼2016-01-18 19:47:27
3楼2016-01-18 20:10:41
沉默的独角兽
金虫 (正式写手)
- 应助: 14 (小学生)
- 金币: 1414.2
- 散金: 2442
- 红花: 7
- 帖子: 687
- 在线: 131.4小时
- 虫号: 1383389
- 注册: 2011-08-29
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-18 22:57:45
hhzxxt: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-01-19 13:15:07
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-18 22:57:45
hhzxxt: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-01-19 13:15:07
|
是不是序列是反向互补的，一般会是这个原因 发自小木虫Android客户端 |
4楼2016-01-18 21:28:04
5楼2016-01-19 09:12:08
6楼2016-01-19 10:45:53
沉默的独角兽
金虫 (正式写手)
- 应助: 14 (小学生)
- 金币: 1414.2
- 散金: 2442
- 红花: 7
- 帖子: 687
- 在线: 131.4小时
- 虫号: 1383389
- 注册: 2011-08-29
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
7楼2016-01-19 11:26:43
8楼2016-01-19 11:26:52
沉默的独角兽
金虫 (正式写手)
- 应助: 14 (小学生)
- 金币: 1414.2
- 散金: 2442
- 红花: 7
- 帖子: 687
- 在线: 131.4小时
- 虫号: 1383389
- 注册: 2011-08-29
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
9楼2016-01-19 11:28:54
10楼2016-01-19 12:40:18