应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 把质粒转化到JM109测序结果不会分析，要看一下目的基因有没有His6尾巴
81/1返回列表
查看: 1830  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

张小蛋

新虫 (小有名气)

[求助] 把质粒转化到JM109测序结果不会分析，要看一下目的基因有没有His6尾巴 已有2人参与

测序结果拿回来了，完全不知道该怎么分析~~有没有大神可以指导一下呢~~一份是测序的图谱，一份是该质粒载体PJ401的序列，导师说要注意基因界限的问题，分析了半天就只会用DNAMAN简单看看基本组成什么的，深了实在不懂，现在当务之急是看一下，我的序列有没有His6尾巴~~因为我现在做提纯纯化不出来~~希望大神帮帮我~~我做的是木聚糖酶的相关课题~~
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : pj401.pdf
    • 2016-01-17 12:05:19, 16.3 K
  • 附件 2 : ZB011120083(Xyn-2)P(ZB011120083.P)_J_A01_-_副本_-_副本.ab1
    • 2016-01-17 12:05:21, 276.85 K

» 猜你喜欢
1楼 2016-01-17 12:06:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张小蛋

新虫 (小有名气)
顶顶顶~~~
回复此楼
2楼2016-01-17 12:10:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

原海亮

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2016-01-18 22:58:59
你目的基因的序列没有么？拿来和测序结果比对一下，确认目的基因的正确性，从ATG到TGA（也可能其他终止密码子），然后根据你设计的酶切位点来看HIS标签的位置，然后在你目的基因的位置往前或后面看看是否有标签。因为标签是载体自身带的，如果你酶切位点没有问题，测序结果也显示有目的基因插入，那么标签一般不是丢失的。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
天空才是极限，我有信心飞的更高！
3楼2016-01-17 16:07:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张小蛋

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-01-17 16:07:15
你目的基因的序列没有么？拿来和测序结果比对一下，确认目的基因的正确性，从ATG到TGA（也可能其他终止密码子），然后根据你设计的酶切位点来看HIS标签的位置，然后在你目的基因的位置往前或后面看看是否有标签。因 ...

附件里就是我目的基因的序列吧~实在是不是很懂~我没有做酶切，这个就是老板从国外要来的质粒，我拿去就测了，然后根据质粒的序列做的引物测的~
赞一下 回复此楼
4楼2016-01-17 17:19:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ps499250429

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
4楼: Originally posted by 张小蛋 at 2016-01-17 17:19:23
附件里就是我目的基因的序列吧~实在是不是很懂~我没有做酶切，这个就是老板从国外要来的质粒，我拿去就测了，然后根据质粒的序列做的引物测的~...

这肯定不行吗！去网上数据库把目的基因搞清楚。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
5楼2016-01-18 08:26:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnnh123

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2016-01-18 22:59:28
测序结果分析主要就是先确定测序结果的可靠性，如果需要拼接，比对时发现突变点就去看峰值图，如果峰值很好认为测序可靠，发生突变，如果峰值很杂，就不用担心，从新选定位置重新测序。然后就要看融合情况，即使发生点突变也不要直接放弃，因为密码子的简并性，有可能你的蛋白并没有变化。查找你的融合位置的第一个起始密码子，删掉前面的序列，直接进行翻译，看是否有提前终止情况。如果没有提前终止，就可以将之与已知蛋白序列比对，看看是否有突变。
赞一下 回复此楼
6楼2016-01-18 16:15:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnnh123

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
张小蛋: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2016-01-18 20:50:05
MTIQPGTGYNNGYFYSYWNDGHGGVTYTNGPGGQFSVNWSNSGNFVGGKGWQPGTKNKVINFSGSYNPNGNSYLSVYGWSRNPLIEYYIVENFGTYNPSTGATKLGEVTSDGSVYDIYRTQRVNQPSIIGTATFYQYWSVRRNHRSSGSVNTANHFNAWAQQGLTLGTMDYQIVAVEGYFSSGSASITVS.LEPQGRHPLISPGERPSLSTEPFVLFDAWQFPTLAWGVPTLPSALRRFTSEFGMGSGGTTALLPPGKQRVL.AIFRYKWARDNVQNWLIGCNTDPYLLIF.IHSNMYPLMRHNPDKCFIILKRRI.
这是将你的序列从RBS后面第一个起始密码子开始翻译的氨基酸序列，在第190个氨基酸后出现终止密码子  你看看是不是你的全场融合蛋白
赞一下 回复此楼
7楼2016-01-18 16:37:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张小蛋

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by hnnh123 at 2016-01-18 16:37:17
MTIQPGTGYNNGYFYSYWNDGHGGVTYTNGPGGQFSVNWSNSGNFVGGKGWQPGTKNKVINFSGSYNPNGNSYLSVYGWSRNPLIEYYIVENFGTYNPSTGATKLGEVTSDGSVYDIYRTQRVNQPSIIGTATFYQYWSVRRNHRSSGSVNTANHFNAWAQQGLTLGTMDYQIVAVEGYFSSGSASITVS.LEPQGRHP ...

谢谢谢谢
回复此楼
8楼2016-01-18 20:49:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 张小蛋 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上函评意见出来了，像什么等级？ 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗？ +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 8/400 2026-09-01 12:58 by ssyjh
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 基金不中，共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭