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张胜博

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 6.5
帖子: 4
在线: 1.9小时
虫号: 3332671
注册: 2014-07-21
专业: 生物化学

[求助] 用的clontech RACE试剂盒，做不出来结果。跪求大家看看是我设计的引物有问题吗？已有4人参与

GGCCGAAGCGGAAGTGCCACGACCACGCGCACTCCGAGAACGTCGCCGGC
GCCTCCGGTGGCCGCTGCCACTGCTCCAAGCGCAGGAAGTCCCGTGTGAA
GCGGATGACCCGCGTTCCGGCGATCAGCTCGAAGGCGGCGGAGATCCCCG
CGGACGACTTCTCGTGGCGCAAGTACGGGCAGAAGCCCATCAAGGGCTCC
CCCTACCCACGAGGCTACTACAAGTGCAGCACGGTGCGCGGTTGCCCGGC
GCGGAAGCACGTGGAGCGCGACCCCAGCGACCCGTCCATGCTCATCGTGA
CCTACGAGGGCGACCACCGCCACACCCCCGGCGACCAGGAACCGGCGGCG
GCGCTCACCCCGCTCCCGGAGCTGCACAAGCTCTGACTGAAGCTTCTTTC
TACCCACCGCTACTACACCGACCTGTTAATTAATTAATTAAAACTTAGCC
TGTCATGCTGTTCCCTTTGTCGCCGTATAGTAGTAGCTAGAGTTTCTTTT
TCTTTTTTGTTTGGTCGCTCGATCGATCCAGTGTATTAGTAGCAGCATGT
AAAAGAATGAGCAACTTAGGGAAGCTTTGAGCAGCTTTGGTCGGAGAAGA
AGAAAGAAGCGAGCGAAAGAAAAAGACGCGCAACTGCTCGTAGTTTTGAC
TGCAAA
这是基因序列片段，做的3RACE，我设计的GSP2引物序列为TGCTGTTCCCTTTGTCGCCGTAT 跪求大家看一看啊

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1楼 2016-01-14 20:59:36

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

prthefu

木虫 (著名写手)

应助: 20 (小学生)
金币: 2573.9
散金: 81
红花: 14
沙发: 1
帖子: 1551
在线: 187小时
虫号: 3083070
注册: 2014-03-24
性别: MM
专业: 生物海洋学与海洋生物资源

【答案】应助回帖

首先，我也是新手，刚做这方面。所以针对你的问题，我只是单纯发表一下我自己的理解。
你贴出了基因的部分序列，一般默认方向为5-3，所以，我在你这段序列（656bp）中先查找ORF,但是，得到的结果如下图1.我找到的是后面的终止密码子，但前面的起始密码子没有，所以，你要做的不应该是5'-race吗？为什么你要做3呢？