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依琪看海

新虫 (小有名气)

[求助] 无缝克隆连接2个片段,如何设计引物?载体使用puc21.详细... 已有1人参与

无缝克隆连接2个片段,如何设计引物?载体使用puc21.详细说明一下。 @biostar2009

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hmtpe

木虫 (初入文坛)

搜一下Gibson assembly,也有相应的试剂盒卖。

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2楼2016-01-14 02:31:03
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依琪看海

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hmtpe at 2016-01-14 02:31:03
搜一下Gibson assembly,也有相应的试剂盒卖。

谢谢 @biostar2009

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3楼2016-01-14 08:16:14
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lifechuteng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
采用引物中引入同源臂的方法,通过PCR将同源臂扩增到产物的两侧。
方法很简单,这里举个例子,(用阿拉伯数字和汉字数字来表示碱基,每个数字代表5个碱基)
例如:
gene序列:1234…………5678
载体序列: …………一二三四五六七八…………
要将gene片段扩增到“四”和“五”之间。
设计引物,先在word中,将一二三四放到1234前面,五六七八放到5678后面,就是如下序列:
一二三四1234…………5678五六七八
然后正向引物就是:一二三四1234
反向引物就是5678五六七八的反向互补。
这两个引物就会将20bp的同源臂加到gene产物中。
4楼2016-01-14 08:59:35
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依琪看海

新虫 (小有名气)

5楼2016-01-14 11:21:18
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lifechuteng

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 依琪看海 at 2016-01-14 11:21:18
2个片段,应该4条引物啊? biostar2009

我上面给您举的例子就是基因的引物,即将同源臂放到gene片段上,而载体上不加同源臂。
载体是需要线性化的,可以通过PCR进行线性化,也可以通过酶切方式切开,实现线性化。
PCR很简单,载体序列:…………一二三四五六七八…………
引物就是F: 五六七八,  R:一二三四的反向互补。
6楼2016-01-14 12:34:49
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依琪看海

新虫 (小有名气)

你给分析下:第一片段正向引物:上游载体的同源序列+第一片段正向序列。
第一片段反向引物:第一片段反向序列+第二片段反向序列
第二片段正向引物:第二片段的正向序列+第一片段的正向
第二片段的反向引物:第二片段的反向序列+载体下游反向序列。
是不是这样啊?忘讲解 @biostar2009

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7楼2016-01-14 13:06:45
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下弦月1022

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lifechuteng at 2016-01-14 08:59:35
采用引物中引入同源臂的方法,通过PCR将同源臂扩增到产物的两侧。
方法很简单,这里举个例子,(用阿拉伯数字和汉字数字来表示碱基,每个数字代表5个碱基)
例如:
gene序列:1234…………5678
载体序列: …… ...

非常感谢您讲的这么清楚,但是想问下,接下来应该怎样做,才可以是目的前段插到载体中间
8楼2016-04-24 09:31:06
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