| 查看: 1010 | 回复: 6 | ||
zeroon木虫 (正式写手)
|
[求助]
高分求助大神帮我优化密码子，能不能解决，进来看看也是学习 已有2人参与
|
|
背景情况是这样的，我现在有一个菌株，已经做了全基因组测序和几个转录组测序，数据都有。 然后呢，我有一段来自酵母的基因序列，要把这段基因放在我这个菌里表达。 前期工作发现，直接把这个基因转入我的菌里，表达量有点低，已经确认启动子没问题，现在判断是密码子没有优化造成的。 而我这个菌目前在各个在线的密码子优化网站中都没有数据。 现在我想优化密码子，请大神指导下，我该具体怎么做？ |
回复此楼» 猜你喜欢
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有181人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
-
留学--博士招生
已经有15人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
zeroon
木虫 (正式写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 1893.6
- 散金: 130
- 红花: 2
- 帖子: 350
- 在线: 68.1小时
- 虫号: 1906280
- 注册: 2012-07-23
- 专业: 微生物遗传育种学
2楼2016-01-09 16:20:25
 |
3楼2016-01-09 17:06:42
 |
4楼2016-01-09 19:37:30
a13515517892
木虫 (小有名气)
- 应助: 74 (初中生)
- 金币: 4597.6
- 散金: 700
- 红花: 14
- 帖子: 292
- 在线: 65.3小时
- 虫号: 1076526
- 注册: 2010-08-18
- 专业: 抗体工程学
5楼2016-01-10 12:11:59
zzhjiangnan
银虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 210
- 散金: 36
- 帖子: 62
- 在线: 63.6小时
- 虫号: 2458857
- 注册: 2013-05-10
- 性别: GG
- 专业: 微生物遗传育种学
6楼2016-01-11 08:55:26
|
密码子优化 密码子是一方面，还有其他条件优化，比如特定功能的Motif，GC含量，mRNA二级结构，限制性酶切位点，及后续的蛋白表达条件优化，对表达量都有影响（关于密码子优化 文章 http://www.detaibio.com/gene-expression-optimization.html） 如果单针对密码子的话，根据氨基酸密码子的简并性可知，替换密码子表达的蛋白不会改变，因此针对特定的表达系统（原核表达，酵母表达或哺乳动物细胞）将现有序列中个系统不喜欢的密码子替换掉，得到新的基因序列即可，这只是针对密码子优化序列的优化，当然也还有其他的，就另说了 |
7楼2016-01-11 10:52:51
5