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zeroon

木虫 (正式写手)

[求助] 高分求助大神帮我优化密码子,能不能解决,进来看看也是学习 已有2人参与

背景情况是这样的,我现在有一个菌株,已经做了全基因组测序和几个转录组测序,数据都有。
然后呢,我有一段来自酵母的基因序列,要把这段基因放在我这个菌里表达。

前期工作发现,直接把这个基因转入我的菌里,表达量有点低,已经确认启动子没问题,现在判断是密码子没有优化造成的。

而我这个菌目前在各个在线的密码子优化网站中都没有数据。

现在我想优化密码子,请大神指导下,我该具体怎么做?
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zeroon

木虫 (正式写手)

3楼2016-01-09 17:06:42
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zeroon

木虫 (正式写手)

求帮助,手工置顶
2楼2016-01-09 16:20:25
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a13515517892

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把你的宿主细胞的密码子频率找到,然后将你需要优化的基因序列分析一下哪些是低频的密码子,替换成高频的即可,也可以找公司
5楼2016-01-10 12:11:59
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zzhjiangnan

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
找公司做即可,但是你可以查下文献,就会发现密码子优化对表达不是百分之百有效
6楼2016-01-11 08:55:26
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