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实验结果与分子模拟结果不一样，怎么办？ 已有1人参与
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各位前辈，老师： 我做曙红B与罗丹明B这两种染料与BSA的吸附实验，实验结果显示一个BSA可以吸附1个罗丹明B或吸附3个曙红B。  罗丹明B 曙红B导师让我用autodock模拟一下这两个分子在BSA上的结合情况。 我在RCSB上下载了三种BSA做对接，名称分别是4F5S（1个对接位点）、4JK4（4个对接位点）、4OR0（3个对接位点）。对接结果是前两种对接不上（affinity大于0），只有最后的4OR0显示这两种分子与其有亲和力。  这是对接后的数据但是问题来了，4OR0与这两种分子对接后显示能吸附2个罗丹明B、或吸附1个曙红B。 这与实验结果严重不符。我该怎么办？请问有什么解决办法吗？ |
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