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汕头大学海洋科学接受调剂
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悠然南子

铁虫 (初入文坛)

[求助] 实验结果与分子模拟结果不一样,怎么办? 已有1人参与

各位前辈,老师:
我做曙红B与罗丹明B这两种染料与BSA的吸附实验,实验结果显示一个BSA可以吸附1个罗丹明B或吸附3个曙红B。
实验结果与分子模拟结果不一样,怎么办?罗丹明B
实验结果与分子模拟结果不一样,怎么办?-1曙红B

导师让我用autodock模拟一下这两个分子在BSA上的结合情况。
我在RCSB上下载了三种BSA做对接,名称分别是4F5S(1个对接位点)、4JK4(4个对接位点)、4OR0(3个对接位点)。对接结果是前两种对接不上(affinity大于0),只有最后的4OR0显示这两种分子与其有亲和力。
实验结果与分子模拟结果不一样,怎么办?-2这是对接后的数据

但是问题来了,4OR0与这两种分子对接后显示能吸附2个罗丹明B、或吸附1个曙红B。
这与实验结果严重不符。我该怎么办?请问有什么解决办法吗?
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zhad33

铜虫 (初入文坛)

肯定看实验结果吧,对接本来就不是准确的

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stayrealkids~
3楼2016-01-07 12:17:47
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Soledum

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

以实验结果为准!对接的目的在于预测试验结果。
4楼2016-01-07 22:46:48
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侯木虫

新虫 (小有名气)

实验结果跟对接不一样能写一篇文章么?

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5楼2018-07-17 23:59:15
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侯木虫

新虫 (小有名气)

你好,我想问下分析对接autodock 亲和力结果在哪看?

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6楼2018-11-24 10:28:45
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